Trattandosi di un [[racemo]], esistono due enantiomeri dell'omeprazolo: l'R-enantiomero e l'S-enantiomero ([[esomeprazolo]]).
NonostanteAnche alcuneper effetto delle differenze a livello di [[farmacocinetica]], tutte le diverse molecole degli IPP nonpossono sembrano avererivelare profili di efficacia clinica significativamente diversi tra loro, anche nella terapia sintomatica nei protocolli per l'eradicazione dell' ''Helicobacter Pylori''; in ambito di sanità pubblica e [[farmacoeconomia]], la scelta tra i diversi IPP dovrebbe quindi tenere conto anche del rapporto costi/benefici, orientandolama anche dell'appropriatezza prescrittiva, orientando la prescrizione in direzione delle molecole più economiche a(come paritàil dil'[[omeprazolo]] efficacia (comeo il [[lansoprazolo]])<ref>, ovvero dell'esomeprazolo in caso di maggiore gravità della patologia.[http://www.regionesardegna.it/documenti/1_73_20060831112145.pdf Evidenze scientifiche sulla scelta degli IPP]</ref>.