Nelle stagioni estive 2003-2004 conduce il [[Festival di Castrocaro Terme]] e [[Sanremo estate]] con [[Toto Cutugno]].
Nel [[Settembresettembre]] [[2003]] prende il posto di [[Alda D'Eusanio]] in [["Al Posto tuo"]] e vi resta fino al 2005. Recentemente ha legato il suo nome al [[reality show]] ''[[La talpa (reality TV)|La talpa]]'', di cui ha presentato le due edizioni (la prima sulla [[RAI Radiotelevisione Italiana|RAI]] in sostituzione di [[Amanda Lear]] mellada stagione[[gennaio]] ad [[2003aprile]]/ [[2004]], la seconda a Mediaset nell' autunno [[2005]]) finora giunte sui palinsesti, e a ''[[Verissimo]]'', che ha condotto dal gennaio [[gennaio2006]] 2006.
Dall'autunno [[2006]] conduce [[Buona Domenica]], che è stata spesso al centro di polemiche date le discutibili doti artistiche di molti tirocinanti della tv presenti. I detrattori del programma lamentano inoltre una crescente volgarità all'interno del contenitore. Dopo le prime puntate del contenitore domenicale, [[Claudio Lippi]] ha deciso di abbandonare il cast, accusando la Perego e gli autori di non lasciargli voce in capitolo. Nonostante tutte le polemiche, la trasmissione si è rivelata un successo battendo sistematicamente [[Domenica In]], così che la conduttrice è stata riconfermata per l'anno successivo.
