Basic local alignment search tool: differenze tra le versioni

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{{Nota disambigua|altri significati di questa parola|Blast|BLAST}}

In [[bioinformatica]], '''BLAST''' ('''B'''asic '''L'''ocal '''A'''lignment '''S'''earch '''T'''ool, ovvero strumento di ricerca di allineamento locale) è un [[algoritmo]] usato per comparare le informazioni contenute nelle [[struttura primaria|strutture biologiche primarie]], come ad esempio le sequenze [[proteina|proteiche]] o le sequenze [[nucleotide|nucleotidiche]] delle molecole di [[DNA]].

== Funzionamento ==

Una ''ricerca BLAST'' permette al ricercatore di confrontare una sequenza di interesse con un [[database]] di sequenze già conosciute, e di identificare tra queste ultime quelle che presentano delle somiglianze con la sequenza di interesse.<ref>{{Cita web|url=https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD%20=%20Web&PAGE_TYPE%20=%20BlastDocs&DOC_TYPE%20=%20DeveloperInfo|titolo=BLAST: Basic Local Alignment Search Tool|sito=blast.ncbi.nlm.nih.gov|lingua=en|accesso=2022-02-23 febbraio 2022}}</ref><ref name=":0">{{Cita libro|autore=David W. Mount|titolo=Bioinformatics Sequence and Genome Analysis|accesso=2022-02-23|annooriginale=2004|lingua=en|ISBN=978-0-87969-712-9}}</ref><ref>{{Cita pubblicazione|nome=Won Cheol|cognome=Yim|nome2=John C.|cognome2=Cushman|data=2017-06-22 giugno 2017|titolo=Divide and Conquer (DC) BLAST: fast and easy BLAST execution within HPC environments|rivista=PeerJ|volume=5|pp=e3486|lingua=en|accesso=2022-02-23 febbraio 2022|doi=10.7717/peerj.3486|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5483034/}}</ref> Ad esempio, in seguito alla scoperta di un [[gene]] di [[Mus musculus|topo]], prima sconosciuto, gli scienziati tipicamente compiono una ricerca BLAST nel [[genoma umano]] per vedere se contiene geni con sequenze somiglianti; una volta trovati i due geni "affini" si può indagare sperimentalmente la funzione di quello proveniente dal topo e ottenere così indizi sulla possibile funzione di quello umano.

È possibile suddividere l'algoritmo BLAST in 3 principali fasi:

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<references />

== Collegamenti esterni ==

* {{cita web|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/|titolo=Il sito internet di NCBI-BLAST}}

* [https://web.archive.org/web/20180930185127/http://www.mpiblast.org/ mpiBLAST] - mpiBLAST è un'implementazione parallela e open-source di NCBI BLAST

* {{cita web |1=http://www.uniclust.it/index.php/it/component/content/article/47-bioclust/98-parallel-blast-bioinformatic.html |2=mpiBLAST Demo |urlmorto=sì }}

{{Controllo di autorità}}