Amplified fragment length polymorphism: differenze tra le versioni

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Riga 2: La '''AFLP-PCR''' o semplicemente '''AFLP''' è un'analisi basata sulla [[Reazione a catena della polimerasi\|PCR]] utilizzata in [[genetica]], per il [[DNA fingerprint]]ing, ed in [[Ingegneria genetica]]. È un metodo estremamente sensibile per individuare [[Polimorfismo (biologia)\|polimorfismi]] a livello del [[DNA]], descritto per la prima volta da Vos et al. nel 1993.<ref>Zabeau, M and P. Vos. 1993. ''Selective restriction fragment amplification: a general method for DNA fingerprinting''. European Patent Office, publication 0 534 858 A1, bulletin 93/13.</ref><ref name=autogenerato1>{{Cita pubblicazione \|autore=Vos P, Hogers R, Bleeker M, ''et al.'' \|titolo=AFLP: a new technique for DNA fingerprinting \|rivista=Nucleic Acids Res. \|volume=23 \|numero=21 \|pp=~~4407–14~~4407-14 \|anno=1995 \|mese=novembre\|id=PMID 7501463 \|pmc=307397 \|url=https://nar.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=7501463 \|doi=10.1093/nar/23.21.4407}}</ref><br/> La procedura è divisa in tre passaggi:<ref>{{cita web \|url=http://www.keygene.com/keygene/techs-apps/FLASH3.php \|titolo=Copia archiviata \|accesso=16 marzo 2013 \|urlmorto=sì \|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20081221174501/http://www.keygene.com/keygene/techs-apps/FLASH3.php }}</ref> Riga 16: La tecnologia AFLP è stata usata in test di paternità e per analisi forensi, nonché per determinare sottili differenze tra popolazioni, ed in studi di [[Geni associati\|linkage]] al fine di generare mappe per l'analisi dei [[Tratto quantitativo\|Tratti quantitativi]]. Esistono numerosi vantaggi nell'usare l'AFLP piuttosto che altre metodiche di [[Marcatori genetici\|marcatura]] come ad esempio [[RAPD]], [[RFLP]], e [[microsatelliti]]. L'AFLP non solo è caratterizzata da maggiore riproducibilità, risoluzione e sensibilità a livello genomico rispetto alle tecniche citate,<ref>{{Cita pubblicazione \|autore=Mueller UG, Wolfenbarger LL \|titolo=AFLP genotyping and fingerprinting \|rivista=Trends Ecol. Evol. (Amst.) \|volume=14 \|numero=10 \|pp=~~389–394~~389-394 \|anno=1999 \|mese=ottobre\|id=PMID 10481200 \|doi=10.1016/S0169-5347(99)01659-6}}</ref> ma ha anche la capacità di amplificare un elevato numero di frammenti simultaneamente. Inoltre, non è necessaria per l'amplificazione alcuna informazione preventiva sulla natura della sequenza.<ref>{{Cita pubblicazione \|autore=Meudt HM, Clarke AC \|titolo=Almost forgotten or latest practice? AFLP applications, analyses and advances \|rivista=Trends Plant Sci. \|volume=12 \|numero=3 \|pp=~~106–17~~106-17 \|anno=2007 \|mese=marzo\|id=PMID 17303467 \|doi=10.1016/j.tplants.2007.02.001 }}</ref> Per questo, l'AFLP è diventata estremamente vantaggiosa nello studio di quei taxa per i quali le informazioni relative al genoma sono limitate, come batteri, funghi e piante. La tecnologia AFLP è sottoposta a brevetti e applicazioni di brevetti da parte di Keygene N.V. Riga 26: == Collegamenti esterni == Software per l'analisi di dati AFLP {{cita testo\|url=http://www.keygene.com/keygene-products/software/quantarsuite.php\|titolo=KeyGene Quantar Suite\|accesso=6 febbraio 2018\|dataarchivio=21 maggio 2008\|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20080521013412/http://www.keygene.com/keygene-products/software/quantarsuite.php\|~~titolo~~urlmorto=~~KeyGene Quantar Suite~~sì}} ''Versatile marker scoring software'' {{cita testo\|url=http://www.softgenetics.com/\|titolo=SoftGenetics}} '''''GeneMarker''''' fragment analysis software Riga 34: Programmi online per la simulazione di AFLP-PCR {{cita testo\|url=http://www.hpa-bioinfotools.org.uk/aflp.html\|titolo=ALFIE\|accesso=17 maggio 2019\|dataarchivio=4 febbraio 2012\|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20120204224018/http://www.hpa-bioinfotools.org.uk/aflp.html\|~~titolo~~urlmorto=~~ALFIE~~sì}} - BProkaryotes or uploaded sequences In silico AFLP-PCR for {{cita testo\|url=http://insilico.ehu.es/AFLP\|titolo=prokaryotes\|postscript=nessuno}}, some {{cita testo\|url=http://insilico.ehu.es/AFLP/index.php?mo=eukarya\|titolo=eukaryotes}} or {{cita testo\|url=http://insilico.ehu.es/user_seqs/\|titolo=uploaded sequences}} *Enzymes for AFLP {{cita testo\|url=http://www.neb.com\|titolo=New England Biolabs}}