SIMAP: differenze tra le versioni

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Il '''Similarity Matrix of Proteins''' (SIMAP) è un [[database]] pubblico che archivia dati sulle sequenze [[proteine|proteiche]] ed utilizza il [[calcolo distribuito]] per rilevarne le somiglianze.

Utilizza il [[Berkeley Open Infrastructure for Network Computing]] (BOINC) come piattaforma per il calcolo distribuito. Il progetto è stato chiuso a maggio 2014.

==Obiettivi del progetto==

Il database del SIMAP è continuamente aggiornato e memorizza tutte le proteine conosciute. Di tutte le proteine esistenti solo una parte è stata studiata abbastanza da scoprirne la funzione. L'idea parte dall'assunto che proteine simili probabilmente hanno funzioni simili. Attraverso quindi il database del SIMAP sarebbe possibile approfondire il comportamento delle proteine simili a quelle più "importanti" come ad esempio quelle relative a malattie o medicinali.

Donando potenza di calcolo a al SIMAP si contribuisce all'ampliamento e all'aggiornamento del database.

==Software==

Simap è sviluppato da Mathias Walter e Michael Böhme studenti di [[bioinformatica]].

Esistono binari precompilati specifici per sistema operativo e architettura. I [[Sistema operativo|sistemi operativi]] supportati sono: [[GNU/Linux]], [[Microsoft Windows]], [[FreeBSD]], [[HP-UX]], [[Solaris (sistema operativo)]], [[NetBSD]].

Esistono binari differenti sia per [[IA-32]] che [[IA-64]].

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Il software è ottimizzato per i processori: PARSIC, [[Sun Microsystems|SUN]] [[SPARC|UltraSparc]], tutti i processori [[Advanced Micro Devices|AMD]] ed [[Intel]].

L'ultima versione di simap per linux è la 5.11 rilasciatapubblicata il [[17 luglio]] [[2006]].

==Voci correlate==

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==Collegamenti esterni==

*{{cita web|1=http://boincsimap.org/boincsimap/|2=Sito ufficiale|lingua=en|accesso=17 ottobre 2011|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20110122203325/http://boincsimap.org/boincsimap/#|dataarchivio=22 gennaio 2011|urlmorto=sì}}

*{{en}} [http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/ Sito ufficiale]

*{{en}} [https://web.archive.org/web/20130528171432/http://mipsliferay.gsfcsb.deunivie.ac.at/servicesportal/analysisweb/simap/ Descrizione dettagliata del progetto] al MIPS

[[Categoria:Calcolo distribuito]]

[[csCategoria:SIMAPBOINC]]

[[de:SIMAP]]

[[en:SIMAP]]

[[es:SIMAP]]

[[fr:Similarity Matrix of Proteins]]