Fa il suo esordio nella massima serie svizzera con la maglia del [[Grasshopper{{Calcio Club ZürichGrasshoppers|Grasshoppers]]N}} durante la stagione 2010-2011 giocando 5 partite e segnando anche un gol. La stagione successiva inizia la stagione con lail squadraclub zurighesedi [[Zurigo]], per vestire poi la maglia del [[Fussballclub{{Calcio Winterthur|Winterthur]]N}}.
Nella sessione invernale di mercato della stagione 2015-2016 viene ingaggiato dall'[[Atalanta{{alcio Bergamasca Calcio|Atalanta]],|N}}<ref>{{Cita news|url=http://radiogoal24.it/2016/01/19/atalanta-acquistato-freuler-dal-lucerna-e-ufficiale/|titolo=Atalanta, acquistato Freuler dal Lucerna: è ufficiale|pubblicazione=RadioGoal24|data=19 gennaio 2016|accesso=6 febbraio 2018}}</ref>, con cui esordisce in [[Serie A]] il 7 febbraio 2016 in Atalanta-Empoli (0-0).<ref>{{Cita news|url=https://www.ecodibergamo.it/stories/Sport/freuler-lesordiente-si-raccontasono-felice-e-sogno-i-tre-punti_1165755_11/|titolo=Freuler, l’esordiente si racconta «Sono felice e sogno i tre punti»|accesso=6 febbraio 2018}}</ref> Il 2 maggio 2016 mette a segno il suo primo gol nella massima serie e in maglia nerazzurra in {{Calcio Napoli|N}}-Atalanta (2-1), grazie ad una deviazione di [[Raúl Albiol|Albiol]].<ref>{{Cita web|url = http://www.gazzetta.it/calcio/fantanews/03-05-2016/magic-cup-napoli-atalanta-gol-freuler-no-autogol-albiol-150463834747.shtml|titolo = Magic, Napoli-Atalanta: il gol è di Freuler. Niente autogol per Albiol|autore = Gasport|sito = [[La Gazzetta dello Sport]]|data = 3 maggio 2016|accesso = 18 settembre 2017}}</ref>
La consacrazione arriverà nelle 2 stagione successive sotto la guida di Gian Piero Gasperini dove Freuler si dimostra una pedina fondamentale per il centrocampo della squadra bergamasca. Tra i gol segnati c'è anche quello del 2-2 definitivo nella partita tra Atalanta e Juventus del 28 aprile 2017.<ref>{{Cita news|url=http://www.repubblica.it/sport/calcio/serie-a/juventus/2017/04/28/news/atalanta-juventus_2-2_freuler_ferma_i_bianconeri-164153689/|titolo=Atalanta-Juventus 2-2: Freuler ferma i bianconeri|pubblicazione=Repubblica.it|data=28 aprile 2017|accesso=9 giugno 2018}}</ref>
