Il compositore [[Akira Ifukube]], che in precedenza aveva rifiutato di comporre la musica di ''[[Gojira VS Spacegojira]]'', consentì di unirsi al progetto, siccome sentì che avendo assistito alla nascita di Godzilla quaranta anni prima, fu giusto assistere alla sua morte. Ifukube inizialmente intendeva dare ad ogni forma di Destoroyah un loro tema musicale, ma infine gli diedediedero tutti lo stesso motifmotivo. Scelse di non usare la sigla del distruttore di ossigeno presente nel film del 1954, siccome quel tema era illustrativo della tragedia del suo creatore, e quindi inappropriato per un mostro.<ref>David Milner, [http://www.davmil.org/www.kaijuconversations.com/ifukub3.htm "Akira Ifukube Interview III"], ''Kaiju Conversations'' (December 1995)</ref> Nel descrivere la sua composizione del tema della morte di Godzilla, disse che fu la composizione più difficile della sua carriera, e che il suo approccio fu come se stesse scrivendo la propria marcia funebre.<ref name="ryfle1998"/>
