Nato e cresciuto a [[Fountain (Colorado)|Fountain, Colorado]], Watts ha studiato alla [[Università di New York|New York University]].<ref>{{cita web|titolo=Cop Car Official Website| url=http://www.focusfeatures.com/cop_car/castncrew?member=jon_watts|editore=Focus Features|lingua=en|accesso=9 ottobre 2015}}</ref> Nel 2011 dirige alcuni episodi dello show satirico ''[[Onion News Network]]''. Nel 2014 dirige il suo primo lungometraggio, ''[[Clown (film)|Clown]]'', seguito l'anno successivo da ''[[Cop Car (film)|Cop Car]]''. Nel 2014, Watts è stato nominato "Filmmaker in Residence" all'[[Atlanta Film Festival]]. Poi è entrato nel comitato consultivo per Trashwater, una associazione no-profit che introduce il sistema di filtraggio per l'acqua pulita negli altri paesi.<ref>{{cita web|url=http://www.ahalfpintproduction.com/pagez/about/|titolo=Jon Watts' Portfolio|lingua=en|accesso=9 ottobre 2015|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20150908115310/http://www.ahalfpintproduction.com/pagez/about/|dataarchivio=8 settembre 2015|urlmorto=sì}}</ref> Watts nel 2017 dirige ''[[Spider-Man: Homecoming]]''<ref>{{cita web|url=http://comicbook.com/2016/04/12/marvel-and-sonys-spider-man-reboot-is-officially-spider-man-/|titolo=Marvel and Sony's Spider-Man Reboot is Officially Spider-Man: Homecoming|autore= Lucas Siegel|data=13 aprile 2016|accesso=13 aprile 2016|sito=ComicBook.com|lingua=en}}</ref>, ossia il film [[Reboot (mass media)|reboot]] di [[Film sull'Uomo Ragno#Marvel Cinematic Universe|Spider-Man]] prodotto dai [[Marvel Studios]] e dalla [[Sony Pictures]], uscito il 7 luglio.<ref>{{cita web|autore=Anthony Breznican|url= http://www.ew.com/article/2015/06/23/jon-watts-new-director-spider-man|titolo=Meet Jon Watts, the new director of Spider-Man|data=23 giugno 2015|accesso=24 giugno 2015|sito=Entertainment Weekly|lingua=en}}</ref> Nel [[2019]] dirige il sequel ''[[Spider-Man: Far from Home]]''.
