'''CRISPR''' (pronuciato comepronuncia: ''crìsper'',; intrascrizione fonetica per l'[[lingua inglese|inglese]]ˈkrɪspər:{{IPA|/krɪspər/|en}})<ref>l'acronimo viene pronunciato "''crisper''" ({{cita web|url=https://www.nature.com/scitable/blog/bio2.0/editing_genomes_with_the_bacterial||titolo=Editing Genomes with the Bacterial Immune System|cognome=Sawyer|nome=Eric|sito=Scitable|editore=Nature Publishing Group|accesso=6 aprile 2015|giorno=9|mese=febbraio|anno=2013|tipo=blog}}); al plurale, nella letteratura scientifica in lingua inglese, viene scritto ''CRISPRs''</ref>, acronimo di ('''Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats''', espressione traducibile in [[Lingua italiana|italiano]] con ''brevi ripetizioni palindrome raggruppate e separate a intervalli regolari''<ref>{{cita pubblicazione|autore=[[Emmanuelle Charpentier]] e [[Pierre Kaldy]]|anno=2016|mese=aprile|titolo=L'enzima che rivoluziona la genetica»|rivista=[[Le Scienze]]|numero=772|pp=28-35}}</ref>) è il nome attribuito a una famiglia di segmenti di [[DNA]] contenenti [[Sequenza ripetuta di DNA|brevi sequenze ripetute]] (di origine fagica o plasmidica) rinvenibili in batteri e [[Archaea|archei]].<ref name="pmid201250852">{{cita pubblicazione|autore=Marraffini LA, Sontheimer EJ|anno=2010|mese=marzo|titolo=CRISPR interference: RNA-directed adaptive immunity in bacteria and archaea|rivista=[[Nature Reviews Genetics]]|volume=11|numero=3|pp=181–190|doi=10.1038/nrg2749|pmid=20125085|pmc=2928866}}</ref> In particolare, le CRISPR sono presenti nel [[Locus genico|locus]] CRISPR insieme ad altri elementi genici sia nei batteri che negli [[Archaea|archei]].
In passato le sequenze erano denominate ''Short Regularly Spaced Repeats'' ( ''brevi ripetizioni a intervalli regolari'', abbreviato in SRSR).
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Queste brevi ripetizioni sono sfruttate dal batterio per riconoscere e distruggere il [[genoma]] proveniente da virus simili a quelli che hanno originato le CRISPR: costituiscono dunque una forma di [[Immunità adattativa|immunità acquisita]] dei procarioti.<ref>{{Cita pubblicazione|nome=Rodolphe|cognome=Barrangou|data=February 2015|titolo=The roles of CRISPR-Cas systems in adaptive immunity and beyond|rivista=Current Opinion in Immunology|volume=32|pp=36–41|accesso=2 ottobre 2017|doi=10.1016/j.coi.2014.12.008|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25574773}}</ref>
Le CRISPR costituiscono uno degli elementi di base del sistema CRISPR/Cas, anch'esso coinvolto nell'immunità acquisita dei procarioti. Una versione semplificata di questo sistema (detta CRISPR/[[Cas9]]) è stata modificata per fornire un potentissimo e precisissimo strumento di [[modificazione genetica]] che risulta di impiego molto più facile, e al contempo più economico, dellerispetto alle tecnologie preesistenti. Grazie al sistema CRISPR/Cas9 è stato possibile modificare permanentemente i geni di molteplici organismi.<ref>{{Cita pubblicazione|nome=Feng|cognome=Zhang|data=15 settembre 2014|titolo=CRISPR/Cas9 for genome editing: progress, implications and challenges|rivista=Human Molecular Genetics|volume=23|numero=R1|pp=R40–46|accesso=2 ottobre 2017|doi=10.1093/hmg/ddu125|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24651067|nome2=Yan|cognome2=Wen|nome3=Xiong|cognome3=Guo}}</ref>
