Inizialmente, Ryo credere di essere in un sogno dovuto ai troppi videogiochi, ma dopo si convince che non ha altra scelta se non quella di salvare i DigiPrescelti dalle grinfie di [[Millenniummon]]. Lungo la sua strada, Ryo trova alcuni Digimon alleati dei DigiPrescelti come Leomon, Piximon e Andromon ma anche Digimon malvagi come Myotismon, Etemon e Piedmon. Infine, Ryo si scontra contro Millenniummon e, dopo una lunga e dura battaglia, il ragazzo libera l'ultimo digiprescelto, Tai. Dopo un caloroso addio rivolto ai suoi nuovi amici, Ryo torna finalmente a casa.
== Digimon presenti ==
Di seguito sono elencati i 182 Digimon presenti nel videogioco. Quelli in grassetto sono i Digimon che compaiono solo in seguito ad una mossa speciale.
{{Colonne inizio}}
*'''AeroVeedramon'''
*Airdramon*
*Agumon
*'''Andromon'''
*'''Angemon'''
*'''Angewomon'''
*Apemon
*'''Asuramon'''
*Bakemon
*Betamon
*'''BigMamemon'''
*'''Birdramon'''
*Biyomon
*'''Blossomon'''
*'''Boltmon'''
*Botamon
*'''Brachiomon'''
*Bukamon
*Candlemon
*Centarumon
*'''Cherrymon'''
*Clockmon
*Cockatrimon
*Coelamon**
*Crabmon
*Cyclonemon
*DarkTyrannomon
*'''Datamon'''
*Deltamon
*DemiDevimon
*DemiMeramon
*Deputymon
*'''Deramon'''
*Devidramon
*Devimon
*'''Digitamamon'''
*'''Divermon'''
*Dokugumon
*Dolphmon
*'''Dragomon'''
*Drimogemon
*Ebidramon
*Elecmon
*Etemon
*'''ExTyrannomon'''
{{Colonne spezza}}
*Flarerizamon
*Floramon
*Flymon
*Frigimon*
*Gabumon
*'''Garbagemon'''
*'''Garudamon'''
*'''Garurumon'''
*Gatomon
*Gazimon
*Gekomon
*Gesomon
*'''Giromon'''
*Gizamon
*Goblimon
*Golemon
*Gomamon
*Gorillamon
*Gotsumon**
*'''Greymon'''
*'''Gryphonmon'''
*Guardromon
*Hagurumon
*'''Ikkakumon'''
*'''Jagamon'''
*'''Jijimon'''
*'''Kabuterimon'''
*Kapurimon
*Kimeramon*
*'''KingEtemon'''
*Kiwimon*
*'''Knightmon'''
*Koromon
*Kokuwamon
*Kunemon
*Kuwagamon
*'''LadyDevimon'''
*Leomon
*'''Lillymon'''
*Machinedramon**
*'''MagnaAngemon'''
*'''Magnadramon'''
*'''Mamemon'''
*'''Mammothmon'''
*'''MarineAngemon'''
{{Colonne spezza}}
*'''MarineDevimon'''
*'''Megadramon'''
*'''MegaKabuterimon'''
*'''MegaSeadramon'''
*Mekanorimon
*Meramon
*'''MetalEtemon'''
*'''MetalGarurumon'''
*'''MetalGreymon'''
*MetalKoromon
*'''MetalMamemon'''
*'''MetalSeadramon'''
*'''MetalTyrannomon'''
*Milleniummon
*Minotarumon
*Mojyamon**
*Mokumon
*Monochromon
*'''Monzaemon'''
*Motimon
*Mushroomon*
*Musyamon
*Myotismon
*Nanimon
*Ninjamon
*Numemon
*Nyokimon
*Octomon**
*Ogremon
*'''Okuwamon'''
*Otamamon
*Pabumon
*Pagumon
*Palmon
*Patamon
*Penguinmon
*'''Phantomon'''
*Pichimon
*Piedmon
*'''Piximon'''
*Poyomon
*'''Pukumon'''
*'''Pumpkinmon'''
*Punimon
*'''Puppetmon'''
*Raremon
{{Colonne spezza}}
*RedVegiemon**
*Roachmon
*'''SaberLeomon'''
*'''Scorpiomon'''
*Seadramon*
*Shellmon
*ShimaUnimon
*'''ShogunGekomon'''
*'''SkullGreymon'''
*'''SkullMammothmon'''
*'''SkullMeramon'''
*'''SkullSatamon'''
*Snimon
*Soulmon
*Starmon
*Sukamon
*Syakomon
*Tanemon
*Tankmon
*Tapirmon
*Tentomon
*'''Togemon'''
*Tokomon
*Tortomon*
*ToyAgumon
*'''Triceramon'''
*Tsunomon
*Tuskmon
*Tyrannomon
*Unimon
*'''Vademon'''
*Veedramon
*Vegiemon*
*'''VenomMyotismon'''
*Vilemon
*'''WarGreymon'''
*'''WaruMonzaemon'''
*'''WereGarurumon'''
*'''Whamon'''
*Wizardmon
*Woodmon**
*Yanmamon
*Yokomon
*Yuramon
*'''Zudomon'''
*Zurumon
{{Colonne fine}}
<nowiki>*</nowiki>Solo nella versione ''Anode''<br>
<nowiki>**</nowiki>Solo nella versione ''Cathode''