I [[sistemi operativi]] supportati dai NUC sono solitamente tutti quelli con supporto all'[[architettura x86]] e generalmente utilizzati nei personal computer., La scelta per cui varia per esempio (oltre a quelli proprietari solitamente già presenti) alla quasi totalità di quelli didella famiglia [[Linux]].
L'installazione di un sistema operativo su diun unIntel NUC spessoavviene devein avveniregenere tramite [[Chiave USB|unità di avvio USB]] o da lettore CDDVD esterno (questo inperché quantoi sonoNUC, solitamenteviste sprovvistile diridotte questidimensioni, ultimisono quasisprovvisti perdi definizionelettore del NUCCD/DVD stessointegrato).