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== Etimologia ==
Probabilmente la parola «giaguaro» deriva del termine [[Lingue tupi-guaraní|tupi-guaraní]] ''yaguara'', che significa «bestia selvatica che abbatte la preda con un balzo».<ref name=Guggisberg1975>{{cita libro | autore=C. A. W. Guggisberg | titolo=Wild Cats of the World | anno=1975 | editore=Taplinger Publishing | città=New York | isbn=978-0-8008-8324-9 | capitolo=Jaguar ''Panthera onca'' (Linnaeus, 1758) | pp=247-265}}</ref><ref name=Seymour/> I popoli indigeni della Guyana lo chiamano ''jaguareté''.<ref>{{cita libro | autore=[[Jean-Baptiste Labat|J. B. Labat]] | anno=1731 | capitolo=Once, espèce de Tigre | titolo=Voyage du chevalier Des Marchais en Guinée, isles voisines, et à Cayenne, fait en 1725, 1726 & 1727 | città=Amsterdam | editore=La Compagnie | volume=III | p=285 | url=https://books.google.com/books?id=dfdWAAAAcAAJ&pg=RA6-PA5 | accesso=13 agosto 2020 | urlarchivio=https://web.archive.org/web/20211129021340/https://books.google.com/books?id=dfdWAAAAcAAJ&pg=RA6-PA5 | urlmorto=no}}</ref> L'appellativo specifico ''onca'' deriva dalla parola portoghese ''onça'', che indicava un felino maculato del Brasile non meglio identificato di dimensioni superiori a quelle di una [[Lynx (zoologia)|lince]] (cfr. l'epiteto specifico ''uncia'' del [[Panthera uncia|leopardo delle nevi]].<ref>{{cita libro | autore=[[John Ray|J. Ray]] | anno=1693 | capitolo=Pardus an Lynx brasiliensis, ''Jaguara'' | titolo=Synopsis Methodica Animalium Quadrupedum et Serpentini Generis. Vulgarium Notas Characteristicas, Rariorum Descriptiones integras exhibens | editore=S. Smith & B. Walford | città=Londra | url=https://archive.org/details/synopsismethodic00rayj/page/168/mode/1up | p=168}}</ref> ''Panthera'', invece, è la forma [[Lingua latina|latinizzata]] del [[Lingua greca antica|greco antico]] ''pánthēr'' (πάνθηρ).<ref>{{cita libro | autore=H. G. Liddell e R. Scott | anno=1940 | capitolo=el:πάνθηρ | titolo=A Greek-English Lexicon | edizione=aggiornata | città=Oxford | editore=Clarendon Press | url=https://www.perseus.tufts.edu/cgi-bin/ptext?doc=Perseus%3Atext%3A1999.04.0057%3Aentry%3D%2377441 | accesso=20 febbraio 2021 | urlarchivio =https://web.archive.org/web/20080411203109/http://www.perseus.tufts.edu/cgi-bin/ptext?doc=Perseus%3Atext%3A1999.04.0057%3Aentry%3D%2377441 | urlmorto=no}}</ref>
Nel 1758 Carlo Linneo descrisse il giaguaro nella sua opera Systema Naturae e gli diede il nome scientifico Felis onca. Nel XIX e XX secolo, diversi esemplari di tipo giaguaro hanno costituito la base per le descrizioni delle sottospecie. Nel 1939, Reginald Innes Pocock riconobbe otto sottospecie in base alle origini geografiche e alla morfologia del cranio di questi esemplari. Pocock non aveva accesso a esemplari zoologici sufficienti per valutare criticamente il loro stato sottospecifico, ma espresse dubbi sullo stato di diversi. Un successivo esame del suo lavoro suggerì che si dovessero riconoscere solo tre sottospecie. La descrizione di P. o. palustris era basato su un teschio fossile.
== Tassonomia ed evoluzione ==
=== Tassonomia ===
Nel 1758 [[Linneo|Carlo Linneo]] descrisse il giaguaro nella sua opera ''[[Systema Naturae]]'' e gli diede il [[Nomenclatura binomiale|nome scientifico]] ''Felis onca''.<ref name=Linn1758>{{cita libro | autore=C. Linnaeus | anno=1758 | capitolo=''Felis onca'' | titolo=Systema naturæ per regna tria naturæ, secundum classes, ordines, genera, species, cum characteribus, differentiis, synonymis, locis | edizione=10 | lingua=la | città=Holmiae | editore=Laurentius Salvius | volume=1 | p=42 | url=https://archive.org/stream/mobot31753000798865#page/41/mode/2up}}</ref> Tra il XIX e il XX secolo, vari [[Tipo nomenclaturale|esemplari tipo]] sono serviti da base per la descrizione di un certo numero di [[sottospecie]].<ref name=MSW3>{{MSW3|id=14000240}}</ref> Nel 1939 [[Reginald Innes Pocock]] ne riconobbe otto in base all'origine geografica e alla [[Morfologia (biologia)|morfologia]] del cranio.<ref name=Pocock1939>{{cita pubblicazione | autore=R. I. Pocock | anno=1939 | titolo=The races of jaguar (''Panthera onca'') | rivista=Novitates Zoologicae | volume=41 | pp=406-422 | url=https://archive.org/details/cbarchive_123320_theracesofjaguarpantheraonca9999}}</ref> Pocock non aveva accesso a esemplari zoologici sufficienti per valutare seriamente la validità del loro stato di sottospecie, ma espresse ugualmente dubbi riguardo alcune di esse. Un successivo riesame del suo lavoro suggerì che si dovessero riconoscere come tali solo tre sottospecie: la descrizione di ''P. o. palustris'', ad esempio, si basava sull'esame di un cranio [[fossile]].<ref name=Seymour>{{cita pubblicazione | autore=K. L. Seymour | anno=1989 | titolo=''Panthera onca'' | rivista=Mammalian Species | numero=340 | pp=1-9 | url=http://www.science.smith.edu/departments/Biology/VHAYSSEN/msi/pdf/i0076-3519-340-01-0001.pdf | urlmorto=sì | urlarchivio=https://web.archive.org/web/20100620231016/http://www.science.smith.edu/departments/Biology/VHAYSSEN/msi/pdf/i0076-3519-340-01-0001.pdf | doi=10.2307/3504096 | jstor=3504096}}</ref>
Nel 2005 venivano ancora considerati taxa validi nove sottospecie, elencate qui sotto con il corrispondente olotipo:<ref name=MSW3/>
▲ | ''P. o. onca'' {{small|(Linnaeus, 1758)}} was a jaguar from Brazil.<ref name=Linn1758 />
* ''P. o. hernandesii'' {{zoo|[[John Edward Gray|J. E. Gray]]|1857}}, un esemplare proveniente da [[Mazatlán]], in Messico;<ref>{{cita pubblicazione | autore=J. E. Gray | anno=1857 | titolo=Notice of a new species of jaguar from Mazatlan, living in the gardens of the Zoological Society | rivista=Proceedings of the Zoological Society of London | volume=25 | p=278 | url=https://archive.org/details/lietuvostsrmoksl56liet/page/278/mode/2up}}</ref>
▲ | ''P. o. peruviana'' {{small|([[Henri de Blainville|De Blainville]], 1843)}} was a jaguar skull from Peru.<ref>{{cite book |author=Blainville, H. M. D. de |year=1843 |chapter=''F. leo nubicus'' |title=Ostéographie ou description iconographique comparée du squelette et du système dentaire des mammifères récents et fossils pour servir de base à la zoologie et la géologie |language=fr |___location=Paris |publisher=J. B. Baillière et Fils |volume=II |page=Plate VIII |url=https://gallica.bnf.fr/ark:/12148/bpt6k6538959f/f171.item |access-date=13 August 2020 |archive-date=29 November 2021 |archive-url=https://web.archive.org/web/20211129021313/https://gallica.bnf.fr/ark:/12148/bpt6k6538959f/f171.item |url-status=live }}</ref>
* ''P. o. paraguensis'' {{zoo|[[Ned Hollister|Hollister]]|1914}}, il cranio di un maschio proveniente dal Paraguay;<ref>{{cita pubblicazione | autore=N. Hollister | anno=1915 | titolo=Two new South American jaguars | rivista=Proceedings of the United States National Museum | volume=48 | numero=2069 | pp=169-170 | url=https://archive.org/details/proceedingsofuni481915unit/page/168/mode/2up | doi=10.5479/si.00963801.48-2069.169}}</ref>
▲ | ''P. o. goldmani'' {{small|(Mearns, 1901)}} was a jaguar skin from Yohatlan in [[Campeche]], Mexico.<ref name=Mearns />
▲ | ''P. o. veraecrucis'' {{small|([[Edward William Nelson|Nelson]] and Goldman, 1933)}} was a skull of a male jaguar from [[San Andrés Tuxtla]] in Mexico.<ref>{{cite journal |author1=Nelson, E. W. |author2=Goldman, E. A. |year=1933 |name-list-style=amp |title=Revision of the jaguars |journal=Journal of Mammalogy |volume=14 |issue=3 |pages=221–240 |doi=10.2307/1373821 |jstor=1373821}}</ref>
Reginald Innes Pocock placed the jaguar in the [[genus]] ''Panthera'' and observed that it shares several morphological features with the [[leopard]] (''P. pardus''). He, therefore, concluded that they are most closely related to each other.<ref name=Pocock1939 /> Results of [[Morphology (biology)|morphological]] and [[genetics|genetic]] research indicate a [[cline (population genetics)|clinal]] north–south variation between populations, but no evidence for subspecific differentiation.<ref name=Eizirik /><ref name=Larson>{{cite journal |last=Larson |first=S. E. |year=1997 |title=Taxonomic re-evaluation of the jaguar |journal=[[Zoo Biology]] |volume=16 |issue=2 |pages=107–120 |doi=10.1002/(SICI)1098-2361(1997)16:2<107::AID-ZOO2>3.0.CO;2-E}}</ref> [[DNA]] analysis of 84 jaguar samples from South America revealed that the [[gene flow]] between jaguar populations in [[Colombia]] was high in the past.<ref>{{cite journal |author1=Ruiz-Garcia, M. |author2=Payan, E. |author3=Murillo, A. |author4=Alvarez, D. |year=2006 |name-list-style=amp |title=DNA microsatellite characterization of the jaguar (''Panthera onca'') in Colombia |journal=Genes & Genetic Systems |volume=81 |issue=2 |pages=115–127 |url=https://www.jstage.jst.go.jp/article/ggs/81/2/81_2_115/_pdf |doi=10.1266/ggs.81.115 |doi-access=free |pmid=16755135 |access-date=13 December 2014 |archive-date=16 December 2014 |archive-url=https://web.archive.org/web/20141216093206/https://www.jstage.jst.go.jp/article/ggs/81/2/81_2_115/_pdf |url-status=live }}</ref> Since 2017, the jaguar is considered to be a [[monotypic taxon]].<ref name="catsg">{{cite journal |author1=Kitchener, A. C. |author2=Breitenmoser-Würsten, C. |author3=Eizirik, E. |author4=Gentry, A. |author5=Werdelin, L. |author6=Wilting, A. |author7=Yamaguchi, N. |author8=Abramov, A. V. |author9=Christiansen, P. |author10=Driscoll, C. |author11=Duckworth, J. W. |author12=Johnson, W. |author13=Luo, S.-J. |author14=Meijaard, E. |author15=O'Donoghue, P. |author16=Sanderson, J. |author17=Seymour, K. |author18=Bruford, M. |author19=Groves, C. |author20=Hoffmann, M. |author21=Nowell, K. |author22=Timmons, Z. |author23=Tobe, S. |year=2017 |name-list-style=amp |title=A revised taxonomy of the Felidae: The final report of the Cat Classification Task Force of the IUCN Cat Specialist Group |journal=Cat News |volume=Special Issue 11 |pages=70–71 |url=https://repository.si.edu/bitstream/handle/10088/32616/A_revised_Felidae_Taxonomy_CatNews.pdf?sequence=1&isAllowed=y#page=70 |access-date=13 May 2018 |archive-date=30 July 2018 |archive-url=https://web.archive.org/web/20180730142355/https://repository.si.edu/bitstream/handle/10088/32616/A_revised_Felidae_Taxonomy_CatNews.pdf?sequence=1&isAllowed=y#page=70 |url-status=live }}</ref>
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