Sposato con Roberta Dini, figlia del fondatore di "Paul & Shark".<ref name = "spo">{{cita web|url=https://www.donnaglamour.it/chi-e-attilio-fontana/curiosita/|titolo=Chi è Attilio Fontana, presidente della Regione Lombardia|data=20 luglio 2020|accesso=28 settembre 2020|sito=donnaglamour.it|autore=Giulia Sbaffi}}</ref> Tre i figli: Maria Cristina (nata nel 1980, avvocato), Giovanni (n.1999) e Marzia (n.2002).<ref name = "att">{{cita web|url=https://www.controcampus.it/2020/06/chi-e-attilio-fontana-biografia-eta-moglie-figli-cv-e-partito/|titolo=Chi è Attilio Fontana|autore=Francesco Di Stasio|data=13 giugno 2020|accesso=28 settembre 2020}}</ref>
È appassionato di golf, tifoso del [[Milan]] e della [[Pallacanestro Varese]].<ref name = "att"/>
