Wikipedia

Amplified fragment length polymorphism: differenze tra le versioni

Naviga nella cronologia in modo interattivo
← Differenza precedenteDifferenza successiva →
Contenuto cancellato Contenuto aggiunto
VisualeWikitesto
Ho eleminato una parte a mio avviso scorretta: cosa sarebbe AFLP se non un acronimo e se non l'animo per Amplified Fragment Length Polymorphism? L'affermazione che ho letto, metteva in discussione l'autorità di diverse università italiane, e dell'NCBI, riferimento centrale nel mondo delle biotechnologie. Sarei stato curioso di sapere, secondo il precedente utente, che cosa significasse, allora, RFLP.
m sistemazione fonti e fix vari
Riga 2:
La '''AFLP-PCR''' o semplicemente '''AFLP''' è un'analisi basata sulla [[Reazione a catena della polimerasi|PCR]] utilizzata in [[genetica]], per il [[DNA fingerprint]]ing, ed in [[Ingegneria genetica]].
 
È un metodo estremamente sensibile per individuare [[Polimorfismo (biologia)|polimorfismi]] a livello del [[DNA]], descritto per la prima volta da Vos et al. nel 1993.<ref>Zabeau, M and P. Vos. 1993. ''Selective restriction fragment amplification: a general method for DNA fingerprinting''. European Patent Office, publication 0 534 858 A1, bulletin 93/13.</ref><ref name=autogenerato1>{{Cita pubblicazione |autore=Vos P, Hogers R, Bleeker M, ''et al.'' |titolo=AFLP: a new technique for DNA fingerprinting |rivista=Nucleic Acids Res. |volume=23 |numero=21 |paginepp=4407–14 |anno=1995 |mese=novembre|id=PMID 7501463 |pmc=307397 |url=https://nar.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=7501463 |doi=10.1093/nar/23.21.4407}}</ref><br/>
La procedura è divisa in tre passaggi:<ref>{{cita web |url=http://www.keygene.com/keygene/techs-apps/FLASH3.php |titolo=Copia archiviata |accesso=16 marzo 2013 |urlmorto=sì |urlarchivio=https://web.archive.org/web/20081221174501/http://www.keygene.com/keygene/techs-apps/FLASH3.php |dataarchivio=21 dicembre 2008 }}</ref>
 
# Digestione del DNA cellulare totale con uno o più [[Enzimi di restrizione]] e legame delle [[Enzimi di restrizione|semi-sequenze di restrizione]] presenti sui frammenti a specifici ''adattori'' (frammenti a sequenza conosciuta);
Riga 9:
# Separazione degli ''ampliconi'' mediante elettroforesi su gel seguita da visualizzazione delle bande.
 
Una variante dell'AFLP è la cDNA-AFLP,<ref>[{{cita testo|url=http://www.keygene.com/keygene/techs-apps/technologies_gene.php |titolo=cDNA-AFLP] {{webarchive|urlurlarchivio=https://web.archive.org/web/20090820163328/http://www.keygene.com/keygene/techs-apps/technologies_gene.php |data=20 agosto 2009 }}</ref> utilizzata per quantificare le differenze in termini di espressione genica.
 
==Applicazioni==
Riga 16:
La tecnologia AFLP è stata usata in test di paternità e per analisi forensi, nonché per determinare sottili differenze tra popolazioni, ed in studi di [[Geni associati|linkage]] al fine di generare mappe per l'analisi dei [[Tratto quantitativo|Tratti quantitativi]].
 
Esistono numerosi vantaggi nell'usare l'AFLP piuttosto che altre metodiche di [[Marcatori genetici|marcatura]] come ad esempio [[RAPD]], [[RFLP]], e [[microsatelliti]]. L'AFLP non solo è caratterizzata da maggiore riproducibilità, risoluzione e sensibilità a livello genomico rispetto alle tecniche citate,<ref>{{Cita pubblicazione |autore=Mueller UG, Wolfenbarger LL |titolo=AFLP genotyping and fingerprinting |rivista=Trends Ecol. Evol. (Amst.) |volume=14 |numero=10 |paginepp=389–394 |anno=1999 |mese=ottobre|id=PMID 10481200 |doi=10.1016/S0169-5347(99)01659-6}}</ref> ma ha anche la capacità di amplificare un elevato numero di frammenti simultaneamente. Inoltre, non è necessaria per l'amplificazione alcuna informazione preventiva sulla natura della sequenza.<ref>{{Cita pubblicazione |autore=Meudt HM, Clarke AC |titolo=Almost forgotten or latest practice? AFLP applications, analyses and advances |rivista=Trends Plant Sci. |volume=12 |numero=3 |paginepp=106–17 |anno=2007 |mese=marzo|id=PMID 17303467 |doi=10.1016/j.tplants.2007.02.001 }}</ref> Per questo, l'AFLP è diventata estremamente vantaggiosa nello studio di quei taxa per i quali le informazioni relative al genoma sono limitate, come batteri, funghi e piante.
 
La tecnologia AFLP è sottoposta a brevetti e applicazioni di brevetti da parte di Keygene N.V.
Riga 26:
== Collegamenti esterni ==
Software per l'analisi di dati AFLP
*[{{cita testo|url=https://web.archive.org/web/20080521013412/http://www.keygene.com/keygene-products/software/quantarsuite.php |titolo=KeyGene Quantar Suite]}} ''Versatile marker scoring software''
*[{{cita testo|url=http://www.softgenetics.com/ |titolo=SoftGenetics]}} '''''GeneMarker''''' fragment analysis software
 
Software gratuito per l'analisi di dati AFLP
*[{{cita testo|url=https://sourceforge.net/projects/genographer/ |titolo=SourceForge]}} '''''Genographer''''' Free software for manual scoring (Java application)
*[{{cita testo|url=https://sourceforge.net/projects/rawgeno/ |titolo=SourceForge]}} '''''RawGeno''''' Free automated scoring (R CRAN environment, including a user-friendly GUI)
 
Programmi online per la simulazione di AFLP-PCR
*[{{cita testo|url=https://web.archive.org/web/20120204224018/http://www.hpa-bioinfotools.org.uk/aflp.html |titolo=ALFIE]}} - BProkaryotes or uploaded sequences
*In silico AFLP-PCR for [{{cita testo|url=http://insilico.ehu.es/AFLP |titolo=prokaryotes]|postscript=nessuno}}, some [{{cita testo|url=http://insilico.ehu.es/AFLP/index.php?mo=eukarya |titolo=eukaryotes]}} or [{{cita testo|url=http://insilico.ehu.es/user_seqs/ |titolo=uploaded sequences]}}
*Enzymes for AFLP [{{cita testo|url=http://www.neb.com |titolo=New England Biolabs]}}
* {{cita web |1url=http://www.keygene.com/keygene/techs-apps/index.php |2titolo=AFLP Technology note at KeyGene |accesso=16 marzo 2013 |urlarchivio=https://web.archive.org/web/20080314031423/http://www.keygene.com/keygene/techs-apps/index.php |dataarchivio=14 marzo 2008 |urlmorto=sì }}
* {{cita web |1url=http://www.softgenetics.com/AFLPApplicationNote.pdf |2titolo=AFLP Applications |accesso=16 marzo 2013 |urlarchivio=https://web.archive.org/web/20070923020002/http://www.softgenetics.com/AFLPApplicationNote.pdf |dataarchivio=23 settembre 2007 |urlmorto=sì }}
 
[[Categoria:DNA]]
Estratto da "https://it.wikipedia.org/wiki/Amplified_fragment_length_polymorphism"