Il principale gestore del trasporto pubblico locale è l'azienda [[Metropolitan Transit Authority of Harris County]] (METRO), che si occupa della gestione della rete automobilistica e dalla [[METRORail|rete tranviaria METRORail]], composta da tre linee per una lunghezza totale di {{M|38,3|u=km}} con 37 stazioni.<ref>{{Cita web |url=http://www.ridemetro.org/Pages/index.aspx |titolo=METRO |sito=ridemetro.org |lingua=en |accesso=3 aprile 2017 |http://www.ridemetro.org/Pages/index.aspx |METRO}}</ref>
La città è servita ancheda dall2 aeroporti: l'[[Aeroporto Intercontinentale di Houston-George Bush]] e l'[[Aeroporto William P. Hobby]]. Houston possiede il maggior numero di ciclisti nello stato del Texas, con oltre 160 miglia di piste ciclabili.<ref>{{Cita web |url=http://houstonbikeways.org/index.php/home/ |titolo=Home |editore=Houstonbikeways.org |accesso=28 giugno 2013 |urlarchivio=https://web.archive.org/web/20130725004319/http://houstonbikeways.org/index.php/home/ |dataarchivio=25 luglio 2013 |urlmorto=sì}}</ref> Attualmente è in fase di completamento un progetto di espansione delle piste ciclabili.<ref>{{Cita web |url=http://houstonbikeways.org/index.php/news/20-current-news/81-new-shared-lane-designation |titolo=New Shared Lane Designation |editore=Houstonbikeways.org |accesso=28 giugno 2013 |urlarchivio=https://web.archive.org/web/20130725004323/http://houstonbikeways.org/index.php/news/20-current-news/81-new-shared-lane-designation |dataarchivio=25 luglio 2013 |urlmorto=sì}}</ref>