{{dx|[[File:Daniel Fonseca - AS Roma 1994-95.jpg|thumb|upright|Fonseca alla Roma nella stagione 1994-1995]]}}
Nella stagione 1997-1998 passò per 9 miliardi di lire alla [[Juventus Football Club|Juventus]] per 9 miliardi di lire<ref>{{cita|Panini, vol. 14|p. 10}}.</ref>, squadra con cui nella prima stagione disputò 15 partite (con 4 gol) in campionato, traa cui lesi qualiaggiunge la finale di [[Champions League 1997-1998|Champions League]] persa per 1-0 contro il [[Real Madrid]], seppur da subentrante. Con la ''Vecchia Signora'' Fonseca rimase altri tre anni, di cui uno solo da titolare (25 partite e 6 gol). Nella stagione 1999-2000, a causa di numerosi e ripetuti infortuni<ref>{{cita news|url=http://archiviostorico.gazzetta.it/1999/ottobre/07/Nella_Juve_rivede_Fonseca_Sto_ga_0_9910072497.shtml|titolo=Nella Juve si rivede Fonseca «Sto meglio, avrò il mio spazio»|pubblicazione=La Gazzetta dello Sport|autore=Paolo Forcolin|data=7 ottobre 1999|accesso=22 novembre 2017}}</ref><ref>{{cita news|url=http://archiviostorico.gazzetta.it/1999/novembre/03/Fonseca_ancora_voglia_ga_0_9911031264.shtml|titolo=Fonseca ha ancora voglia|pubblicazione=La Gazzetta dello Sport|autore=Paolo Forcolin|data=3 novembre 1999|accesso=22 novembre 2017}}</ref><ref>{{cita news|url=http://archiviostorico.gazzetta.it/1999/novembre/07/Zidane_colora_bianconero_ga_0_9911076967.shtml|titolo=Zidane colora il bianconero|autore=Paolo Forcolin, Salvatore Lo Presti, Giancarlo Galavotti|pubblicazione=La Gazzetta dello Sport|data=7 novembre 1999|accesso=22 novembre 2017}}</ref><ref>{{cita news|url=http://archiviostorico.gazzetta.it/1999/dicembre/15/Dai_Fonseca_provaci_ancora_ga_0_9912154638.shtml|titolo=Dai Fonseca, provaci ancora|pubblicazione=La Gazzetta dello Sport|autore=Paolo Forcolin|data=15 dicembre 1999|accesso=22 novembre 2017}}</ref><ref>{{cita news|url=http://archiviostorico.gazzetta.it/2000/gennaio/11/Ancelotti_mette_dietro_punte_Difende_ga_0_0001115354.shtml|titolo=Ancelotti si mette dietro le punte|pubblicazione=La Gazzetta dello Sport|autore=Paolo Forcolin, Maurizio Nicita|data=11 gennaio 2000|accesso=22 novembre 2017}}</ref>, non scese mai in campo in campionato (disputò soltanto una gara di Coppa UEFA contro il Levski Sofia il 4 novembre 1999<ref>{{cita news|url=http://archiviostorico.gazzetta.it/1999/novembre/05/Zidane_sveglia_Juve_ga_0_9911051544.shtml|titolo=Zidane sveglia la Juve|pubblicazione=La Gazzetta dello Sport|autore=Salvatore Lo Presti, Paolo Forcolin, Francesco Bramardo|data=5 novembre 1999|accesso=22 novembre 2017}}</ref> e un incontro di Coppa Italia contro il Napoli il 16 dicembre 1999<ref>{{cita news|url=http://archiviostorico.gazzetta.it/1999/dicembre/17/Esnaider_riscalda_Juve_ga_0_9912175901.shtml|titolo=Esnaider riscalda la Juve|pubblicazione=La Gazzetta dello Sport|autore=Paolo Forcolin, Salvatore Lo Presti|data=17 dicembre 1999|accesso=22 novembre 2017}}</ref>). Nella stagione 2000-2001 collezionò 2 presenze in Serie A e 1 in Coppa Italia; nel corso della stagione successiva rescisse coi bianconeri per accasarsi al [[Club Atlético River Plate|River Plate]]. La sua avventura con i torinesi si concluse con la vittoria di uno scudetto e una Supercoppa italiana.
Con gli argentini del River ebbe poco spazio e dopo due mesi decise di tornare prima al Nacional Montevideo (5 presenze e 2 gol), dove vinse uno scudetto, e poi di nuovo in Italia, al {{Calcio Como|N}}. Nel corso della stagione, visto lo scarso utilizzo (2 presenze), decise di dare l'addio al calcio giocato.
