Pratt morì il 20 agosto 1995 a causa di un [[Carcinoma deldell'intestino|tumore colon-rettoall'intestino]].<ref>{{cita giornale|cancrourl=http://www.archiviolastampa.it/component/option,com_lastampa/task,search/mod,libera/action,viewer/Itemid,3/page,1/articleid,0719_01_1995_0225_0001_10624475/anews,true/|titolo=Corto delMaltese colon-rettoresta orfano|pubblicazione=''[[La stampa]].''|pagina=11|data=21 agosto 1995|accesso=18 ottobre 2025}}</ref><ref>Hugo Pratt, ''Le désir d'être inutile - Souvenirs et reflections'', Entretiens avec Dominique Petitfaux. Robert Laffont, Paris, 1999.</ref> Fu sepolto alle porte del paese di [[Grandvaux (Bourg-en-Lavaux)|Grandvaux]], nel [[Canton Vaud]] in [[Svizzera]], dove viveva dal 1984 nella sua casa situata nei pressi del [[Lago Lemano]].<ref>{{cita web|url=https://ricerca.repubblica.it/repubblica/archivio/repubblica/1995/08/25/ultimo-saluto-hugo-pratt-tra-le.html|titolo=L' ULTIMO SALUTO A HUGO PRATT TRA LE NOTE DI DIZZIE GILLESPIE|data=25 agosto 1995|accesso=21 gennaio 2023}}</ref>
