Le carte vengono rappresentate in due modi diversi a seconda delle versioni. La versione Giapponesegiapponese le presenta come le prime carte che sono uscite qualche anno prima, in europa sono come le carte normali che vengono ancora stampate oggi. Le carte in totale sono 722, la maggior parte sono mostri, con pochissime carte magie e trappola. Tutti i mostri non hanno alcun effetto e gli effetti delle carte magie e trappole sono differenti da quelle originali. Tutte le carte mostro possono avere deu simboli che stannnostanno a rappresentare il tipo di mostro. Quando la carta viene evocata o posizionata sul terreno si può sceglirescegliere quale segno attribuirgli. Ogni segno ha un un altro segno che è più forte di lui e un più debole. Quando si scontrano due mostri con simboli differenti che non hanno nessun legame,i valori di attacco e difesa rimangono uguali, mentre se un segno è più forte dell'altro il mostro con il segno più forte guadagna 500 punti di attacco e di difesa.
La carta mostro con attacco maggiore:[[DragoFianleBlue-eyes Occhi Blu]]Ultimate Dragon,con 4500 punti di attacco.
La carta mostro con difesa maggiore:[[DragoFinaleBlue-eyes Occhi Blu]]Ultimate Dragon,con 3800 punti di difesa.
La carta magia più rara:Megaphorm Megamorph,che aumenta l'attacco e la difesa di qualsiasi mostro di 1000 punti.
La carta trappola più rara:RovineWidespread diffuseRuin,che distrugge qualsiasi mostro che attacchi il controllore di questa carta (può essere usata solounasolo una volta).
