La prima squadra fondata nella città di Neuchâtel è, nel 1893, il ''FC Neuchâtel-Rovers''; al nome in brevepiù tempotardi (1905) verrà rimossa la seconda parte, rimanendo ''FC Neuchâtel''. Questa compagine partecipa a 6 campionati dell'epoca pionieristica del campionato elvetico (prima apparizione nel 1898). Nel 1906 questo club ed il ''FC Vignoble'' (fondato nel 1900), fondendosi, danno vita ad una nuova squadra, il ''FC Cantonal Neuchâtel'', che nel campionato [[Campionato di calcio svizzero 1915-1916|1915-16]] riesce ad aggiudicarsi il titolo nazionale (il primo ed unico della sua storia), sconfiggendo nel girone finale [[FC Winterthur|FC Winterthur-Veltheim]] e [[BSC Old Boys Basel]].
Il Cantonal resterà la principale squadra della città fino alla fine degli anni Sessanta.
