La personalità del personaggio ha mostrato di avere diverse sfaccettature: il Dottore è stato infatti descritto come un uomo imprevedibile, clownesco e infantile, ma al contempo saggio, serioso e oscuro.<ref name="telegraph" />
Sebbene ciascun interprete abbia rappresentato il personaggio a suo modo, tutte le versioni del Dottore condividono la sua natura compassionevole e pacifista: egli infatti dedica la sua vita alla preservazione della vita, sia umana che aliena, battendosi contro il male e la guerra. Ciononostante, ha anche ucciso per legittima difesa,<ref name=the_tomb_of_the_cybermanthe_tomb_of_the_cybermen/><ref name=the_dominators>{{cita episodio/temp|titolo=The Dominators|stagione=6|episodio=1|serie=Doctor Who}}</ref name=the_invasion>{{cita episodio/temp|titolo=The Invasion|stagione=6|episodio=11|serie=Doctor Who}}</ref><ref name=the_krotons>{{cita episodio/temp|titolo=The Krotons|stagione=6|episodio=19|serie=Doctor Who}}</ref><ref name=spearhead_from_space>{{cita episodio/temp|titolo=Spearhead from Space|stagione=7|episodio=1|serie=Doctor Who}}</ref name=the_sea_devils>{{cita episodio/temp|titolo=The Sea Devils|stagione=9|episodio=9|serie=Doctor Who}}</ref><ref name=the_three_doctors>{{cita episodio/temp|titolo=The Three Doctors|stagione=10|episodio=1|serie=Doctor Who}}</ref><ref name=the_brain_of_morbius>{{cita episodio/temp|titolo=The Brain of Morbius|stagione=13|episodio=17|serie=Doctor Who}}</ref><ref name=the_talons_of_weng_chiang>{{cita episodio/temp|titolo=The Talons of Weng-Chiang|stagione=14|episodio=21|serie=Doctor Who}}</ref><ref name=the_invasion_of_time/><ref name=earthshock>{{cita episodio/temp|titolo=Earthshock|stagione=19|episodio=19|serie=Doctor Who}}</ref><ref name=vengeance_on_varos>{{cita episodio/temp|titolo=Vengeance on Varos|stagione=22|episodio=3|serie=Doctor Who}}</ref><ref name=the_two_doctors>{{cita episodio/temp|titolo=The Two Doctors|stagione=22|episodio=7|serie=Doctor Who}}</ref><ref name=silver_nemesis>{{cita episodio/temp|titolo=Silver Nemesis|stagione=25|episodio=8|serie=Doctor Who}}</ref><ref name=alieni_a_londra_II>{{cita episodio/temp|titolo=Alieni a Londra (seconda parte)|titolooriginale=World War Three|stagione=1|episodio=5|serie=Doctor Who (nuova serie)}}</ref><ref name=the_christmas_invasion/><ref name=l_impero_del_lupo/> <ref name=l_ascesa_dei_cyberuomini_II>{{cita episodio/temp|titolooriginale=The Age of Steel|titolo=L'ascesa dei Cyberuomini (seconda parte)|stagione=2|episodio=6|serie=Doctor Who (nuova serie)}}</ref><ref name=la_sposa_perfetta>''[[Episodi_speciali_di_Doctor_Who#La_sposa_perfetta|La sposa perfetta]]'' (''The Runaway Bride''), episodio speciale, ''Doctor Who (nuova serie)''</ref><ref name=alieni_sulla_luna/> spingendosi fino al genocidio nei confronti dei Dalek, i suoi più grandi nemici (nel serial ''[[Episodi di Doctor Who (venticinquesima stagione)|Remembrance of the Daleks]]'', ad esempio, ordina la distruzione del loro pianeta natale).
Non fa uso di armi (ad eccezione dell'innocuo [[cacciavite sonico]]) ed è critico contro chi usa la forza; ha invece fatto più volte uso di trucchi per ingannare i suoi avversari, confondendoli con le parole o con un comportamento bizzarro.
