Il brano venne eseguito per la prima volta dal vivo nel 1991, malgrado Cobain non avesse ancora scritto il testo della parte del [[Bridge (musica)|bridge]]<ref>{{Cita|Gaar|p. 19|Gaar, 2006}}</ref>.
Agli [[MTV Video Music Awards]] del 9 settembre 1992 il gruppo aveva intenzione di eseguire ''Rape Me''. All'inizio, però, [[MTV]] aveva detto loro che sarebbe andata bene qualunque canzone avessero suonato, ma poi insistette affinché suonassero al suo posto ''[[Smells Like Teen Spirit]]''. Alcune ore prima che lo show cominciasse i Nirvana si rifiutarono di esibirsi; tuttavia, preoccupati dal fatto che facendo così la rete avrebbe probabilmente [[boicottaggioBoicottaggio|boicottato]] altri artisti legati alla loro etichetta discografica, decisero di suonare ''[[Lithium (Nirvana)|Lithium]]''. Una volta sul palco Cobain iniziò a suonare e cantare ''Rape Me''; in preda al panico, MTV stava per interrompere il programma e lanciare la [[pubblicità]] quando il gruppo proseguì suonando ''Lithium''. Cobain disse che aveva fatto ciò "solo per dare [ad MTV] un piccolo sobbalzo al [[cuore]]"<ref>{{Cita|Azerrad|pp. 276-277|Azerrad, 1994}}</ref>.
Distributori del calibro di [[Walmart]] e [[Kmart]] sostituirono sul retro della copertina di ''In Utero'' il titolo del brano con ''Waif Me'' ritenendo il vero titolo troppo controverso<ref>Schinder, Scott ed Andy Schwartz. ''Icons of Rock'' Volume 2. Greenwood, 2007. 608</ref>. Inoltre, MTV affermò che non avrebbe trasmesso un eventuale [[videoclip]] di "Rape Me" e così il gruppo per protesta decise che non avrebbe realizzato un video neanche per "All Apologies", la quale era una hit di maggior successo.
