Il 16 novembre [[2008]], Janko divenne il leader del club di tutti i tempi per le reti segnate in una stagione. Ben 25 goal superando il record di [[Oliver Bierhoff]], che segnò 23 reti durante la stagione 1990-91<ref name="nomecompleto">{{cita web |url=http://sciabolatamorbida.wordpress.com/2009/06/02/marc-janko-il-bomber-viennese-che-fa-impazzire-salisburgo/ |titolo=Marc Janko, il bomber viennese che fa impazzire Salisburgo |editore=voanews.com |lingua=en |data=24-06-2009 |accesso=24-10-2010}}</ref>
Il 22 giugno [[2010]] viene acquistato dal [[Football Club Twente|Twente]] per una cifra vicina ai 7 milioni di euro, Janko ha firmato un quadriennale. L'8 maggio [[2011]] vince la [[CoppaKNVB d'Olandabeker 2010-2011|Coppa d'Olanda]] dopo aver segnato il gol decisivo del 3-2 ai supplementari contro l'[[Amsterdamsche Football Club Ajax|Ajax]]. Inizia la stagione con un goal su calcio di rigore che da la vittoria al Twente in casa del NAC Breda. Due settimane dopo segna una [[Gol#Doppietta|doppietta]] in casa dell'Heerenveen. Il 15 ottobre segna una [[Gol#Tripletta|tripletta]] contro l'RKC Waalwijk. Il 22 dicembre, nella partita valida per la [[KNVB beker|KNVB Beker]] realizza una marcatura contro il [[Philips Sport Vereniging|PSV Eindhoven]] su [[calcio di rigore|rigore]] (2-1 per il PSV). Questo è stato l'ultimo gol segnato con la maglia del [[FC Twente|Twente]].
Inizia la stagione con un goal su calcio di rigore che da la vittoria al Twente in casa del NAC Breda. Due settimane dopo segna una [[Gol#Doppietta|doppietta]] in casa dell'Heerenveen. Il 15 ottobre segna una [[Gol#Tripletta|tripletta]] contro l'RKC Waalwijk. Il 22 dicembre, nella partita valida per la [[KNVB Beker]] realizza una marcatura contro il [[PSV Eindhoven]] su [[calcio di rigore|rigore]] (2-1 per il PSV). Questo è stato l'ultimo gol segnato con la maglia del [[FC Twente|Twente]]: il 31 gennaio [[2012]], ultimo giorno di [[calciomercato]], viene acquistato dai portoghesi del [[Futebol Clube do Porto|Porto]] per 3 milioni di euro. Janko, che lascia la squadra olandese dopo aver giocato in totale 64 partite e segnato 31 gol, firma un contratto fino al 30 giugno [[2015]] con una clausola di rescissione pari a 20 milioni di euro.<ref>{{Cita news|url=http://www.fcporto.pt/Noticias/Futebol/noticiafutebol_futjankoassinatura_310112_66603.asp|titolo=Marc Janko assinou até 2015|editore=fcporto.pt|lingua=pt|data=31 gennaio 2012|accesso=31 gennaio 2012}}</ref>
