A metà luglio del 2015 è statofu rapito dai militanti dello Stato Islamico e ripetutamente torturato<ref>{{Cita web |url =http://www.spiegel.de/wissenschaft/mensch/islamischer-staat-archaeologen-trauern-um-enthaupteten-mr-palmyra-khaled-al-asaad-a-1048897.html |titolo = IS enthauptet Forscher: Entsetzen über Mord an "Mr. Palmyra" |autore =Angelika Franz |sito =spiegel.de |data =19 agosto 2015 |lingua = de |accesso = 19 agosto 2015}}</ref>. Il quotidiano britannico ''[[The Guardian]]'' ha riferitoriferì che Asaad avrebbe rifiutato di fornire informazioni su dove fossero nascoste antiche opere d'arte. Il 18 agosto 2015 Asaad è statovenne ucciso sulla piazza di fronte al Museo della città nuova di Palmira, Tadmor, e in seguito il suo corpo decapitato è statofu esposto al pubblico.
=== Ricordo dello studioso ===
Il responsabile del dipartimento Medio Oriente al British Museum racconta dell'amore di Khaled al-Asaad per Palmira. Riferisce che aveva conosciuto lo studioso siriano nel 1980. All'inizio furono solo colleghi, poi divennero amici. ''Un amico, che mi ha sempre accolto, durante le mie visite quasi annuali in Siria, fino al 2008''.