Amplified fragment length polymorphism: differenze tra le versioni

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La '''AFLP-PCR''' o semplicemente '''AFLP''' è un'analisi basata sulla [[Reazione a catena della polimerasi|PCR]] utilizzata in [[genetica]], per il [[DNA fingerprint]]ing, ed in [[Ingegneria genetica]].

È un metodo estremamente sensibile per individuare [[Polimorfismo_Polimorfismo (biologia)|polimorfismi]] a livello del [[DNA]], descritto per la prima volta da Vos et al. nel 1993.<ref>Zabeau, M and P. Vos. 1993. Selective restriction fragment amplification: a general method for DNA fingerprinting. European Patent Office, publication 0 534 858 A1, bulletin 93/13.</ref><ref name=autogenerato1>{{Cita pubblicazione |autore=Vos P, Hogers R, Bleeker M, ''et al.'' |titolo=AFLP: a new technique for DNA fingerprinting |rivista=Nucleic Acids Res. |volume=23 |numero=21 |pagine=4407–14 |anno=1995 |mese=novembre|id=PMID 7501463 |pmc=307397 |url=http://nar.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=7501463 |doi=10.1093/nar/23.21.4407}}</ref> La procedura è divisa in tre passaggi:<ref>[http://www.keygene.com/keygene/techs-apps/FLASH3.php]</ref>

# Digestione del DNA cellulare totale con uno o più [[Enzimi di restrizione]] e legame delle [[Enzimi di restrizione|semi-sequenze di restrizione]] presenti sui frammenti a specifici ''adattori'' (frammenti a sequenza conosciuta);

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La tecnologia AFLP ha la capacità di individuare contemporaneamente diversi polimorfismi in differenti regioni [[genoma|genomiche]], ed è inoltre caratterizzata da elevate sensibilità e riproducibilità. Di conseguenza, questa tecnica è largamente usata per l'identificazione di variazione genetica in ceppi o specie strettamente correlate di piante, funghi, animali e batteri.

La tecnologia AFLP è stata usata in test di paternità e per analisi forensi, nonché per determinare sottili differenze tra popolazioni, ed in studi di [[Geni associati|linkage]] al fine di generare mappe per l'analisi dei [[Tratto_quantitativoTratto quantitativo|Tratti quantitativi]].

Esistono numerosi vantaggi nell'usare l'AFLP piuttosto che altre metodiche di [[Marcatori genetici|marcatura]] come ad esempio [[RAPD]], [[RFLP]], e [[microsatelliti]]. L'AFLP non solo è caratterizzata da maggiore riproducibilità, risoluzione e sensibilità a livello genomico rispetto alle tecniche citate,<ref>{{Cita pubblicazione |autore=Mueller UG, Wolfenbarger LL |titolo=AFLP genotyping and fingerprinting |rivista=Trends Ecol. Evol. (Amst.) |volume=14 |numero=10 |pagine=389–394 |anno=1999 |mese=ottobre|id=PMID 10481200 |url=http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0169534799016596 |doi=10.1016/S0169-5347(99)01659-6}} </ref> ma ha anche la capacità di amplificare un elevato numero di frammenti simultaneamente. Inoltre, non è necessaria per l'amplificazione alcuna informazione preventiva sulla natura della sequenza.<ref>{{Cita pubblicazione |autore=Meudt HM, Clarke AC |titolo=Almost forgotten or latest practice? AFLP applications, analyses and advances |rivista=Trends Plant Sci. |volume=12 |numero=3 |pagine=106–17 |anno=2007 |mese=marzo|id=PMID 17303467 |doi=10.1016/j.tplants.2007.02.001 }}</ref> Per questo, l'AFLP è diventata estremamente vantaggiosa nello studio di quei taxa per i quali le informazioni relative al genoma sono limitate, come batteri, funghi e piante.

La tecnologia AFLP è sottoposta a brevetti e applicazioni di brevetti da parte di Keygene N.V.

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*In silico AFLP-PCR for [http://insilico.ehu.es/AFLP prokaryotes], some [http://insilico.ehu.es/AFLP/index.php?mo=eukarya eukaryotes] or [http://insilico.ehu.es/user_seqs/ uploaded sequences]

*Enzymes for AFLP [http://www.neb.com New England Biolabs]

* [{{cita web|http://www.keygene.com/keygene/techs-apps/index.php |AFLP Technology note at KeyGene]}}

* [{{cita web|http://www.softgenetics.com/AFLPApplicationNote.pdf |AFLP Applications]}}

[[Categoria:DNA]]