A partire dal 1º maggio [[2004]] il palazzo ospita anche i vertici del [[Consiglio europeo]].
AllaDal 2017, dopo la conclusione dei lavori di costruzione dell'adiacente [[palazzo Europa]], la sede principale dei vertici del [[Consiglio europeo]], del [[Presidente del Consiglio europeo|suo presidente]] e delle riunioni del [[Consiglio dell'Unione europea]] saràè stata trasferita nel nuovo edificio; il palazzo Justus Lipsius continueràcontinua ad ospitare gli uffici del [[Segretariato generale del Consiglio dell'Unione europea]]<ref>{{cita web|url=http://www.consilium.europa.eu/it/contact/address/council-buildings/europa-building/|titolo=Palazzo Europa|data=8 dicembre 2016|accesso=15 dicembre 2016}}</ref>.
