Le 20 squadre vengono divise in due [[gironi all'italiana]] andata e ritorno, alla conclusione delle 34 giornate:<br />Le vincitrici dei due gironi vengono promosse in [[Prva liga SR Jugoslavije 1997-1998|Prva Liga B 1997-98]].<br />Le seconde classificate dei due gironi vanno agli spareggi contro terz'ultima e quart'ultima di [[Prva liga SR Jugoslavije 1996-1997|Prva Liga B 1996-97]].<br />Le ultime classificate (in numero variabile a seconda della provenienza delle retrocesse dalla Prva Liga) retrocedono nella [[Srpska Liga]].
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|caption = Ubicazione delle squadre della Druga Liga 1996-97
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Le 20 squadre vengono divise in due [[gironi all'italiana]] andata e ritorno; le migliori squadre della stagione precedente sono inserite nel Gruppo A, le rimanenti in quello B.
Alla conclusione delle 18 giornate disputate in autunno, le ultime 4 squadre del Gruppo A passano nel Gruppo B e vengono sostituite dalle migliori 4 del Gruppo B. In base al piazzamento vengono assegnati punti-bonus che le squadre si portano in dote nella fase primavera.
Al termine delle 18 giornate disputate in primavera:<br />La prima del Gruppo A disputa uno spareggio contro la 14ª della Prva Liga per un posto in [[Prva liga SR Jugoslavije 1996-1997|Prva Liga A 1996-97]].<br />Le squadre piazzatesi dal 2º al 4º posto del Gruppo A e la prima del Gruppo B accedono alla [[Prva liga SR Jugoslavije 1996-1997|Prva Liga B 1996-97]].<br />La squadra piazzata al 5º posto del Gruppo A disputa uno spareggio contro la 19ª della Prva Liga per un posto in [[Prva liga SR Jugoslavije 1996-1997|Prva Liga B 1996-97]].<br />Le ultime due del Gruppo B retrocedono in Sprska Liga.
È la prima stagione con la vittoria da tre punti anziché due.
Dalla [[Druga liga SR Jugoslavije 1996-1997|prossima stagione]], invece di 20 squadre in due leghe A e B autunno & primavera, si passerà a 36 squadre divise in due gironi Est e Ovest da 18 ciascuno.
