Stem-loop: differenze tra le versioni
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Diceva "DNA a signola elica" che, oltre ad avere un errore grammaticale, non ha senso, poiché l'elica si chiama tale quando è un doppio filamento. L'ho cambiato in ciò che dovrebbe essere, ovvero "DNA a singolo filamento". |
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{{O|biologia|marzo 2018}}
[[File:Stem-loop.svg|miniatura|Un esempio di RNA stem-loop]]
Lo '''stem-loop''' è una conformazione intramolecolare basata sull'[[Coppia di basi|accoppiamento delle basi azotate]] che può insorgere a livello di un [[DNA]] a
Essa insorge quando due regioni dello stesso filamente si accoppiano in accordo con le regole di appaiamento delle [[basi azotate]] formando una doppia elica che termina in un'ansa non appaiata. Generalmente le regioni che manifestano questa struttura sono provvisti di una sequenza complementare se lette in direzioni opposte. Lo stem-loop è una struttura che sta alla base di molte conformazioni secondarie dell'RNA ed ha molte funzioni di fondamentale utilità, come ad esempio può influenzare il ripiegamento strutturale del filamento, ha funzione protettiva per l'RNA messagero (mRNA), può fornire l'RNA di siti di riconoscimento per proteine specifiche (RNA binding proteins) e funge da substrato per reazioni enzimatiche.<ref>Svoboda, P., & Cara, A. (2006). Hairpin RNA: A secondary structure of primary importance. Cellular and Molecular Life Sciences CMLS, 63(7), 901-908.</ref>
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Lo stem-loop presente a livello della [[sequenza di Shine-Dalgarno]] funge da controllo dell'inizio della traduzione.<ref name=" doi: 10.1111/j.1365-2958.2009.06840.x">{{Cita pubblicazione|autore= Malys N, Nivinskas R |titolo= Non-canonical RNA arrangement in T4-even phages: accommodated ribosome binding site at the gene 26-25 intercistronic junction |rivista= Mol Microbiol |volume= 73 |numero= 6 |pp= 1115–1127 |anno= 2009 | pmid = 19708923 | doi =10.1111/j.1365-2958.2009.06840.x }}</ref><ref name=" doi: 10.1007/s00018-010-0588-z">{{Cita pubblicazione|autore= Malys N, McCarthy JEG |titolo= Translation initiation: variations in the mechanism can be anticipated |rivista= Cellular and Molecular Life Sciences |anno= 2010 | doi =10.1007/s00018-010-0588-z | pmid=21076851 |volume= 68 |numero= 6 |pp= 991–1003}}</ref>
È anche importante citare l'utilità di questa struttura all'interno della terminazione rho-indipendente della trascrizione all'interno dei procarioti. La struttura stem-loop va a formarsi sulla sequenza di mRNA in fase di trascrizione e causa la dissociazione della [[RNA polimerasi]] dal filamento stampo. Questo processo prende il nome di terminazione rho-indipendente o terminazione intrinseca e la sequenza coinvolta prende il nome di [[Terminatore (biologia)|terminatore]]<nowiki/>.
== Note ==
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