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* [[1989年]]([[平成]]元年)[[3月11日]]:宇部新川駅・雀田駅 - 長門本山駅間でワンマン運転開始<ref name="kotsu_2011">ジェー・アール・アール編『JR気動車客車編成表 2011』交通新聞社、2011年。ISBN 978-4-330-22011-6。</ref><ref>{{Cite book|和書 |date=1991-08-01 |title=JR気動車客車編成表 '91年版 |chapter=JR年表 |page=194 |publisher=ジェー・アール・アール |ISBN=4-88283-112-0}}</ref>。
* [[1990年]](平成2年)6月1日:[[宇部新川鉄道部]]の発足に伴い、全線(小野田駅構内を除く)が広島支社直轄から同鉄道部の管轄になる<ref>『データで見るJR西日本 2001』西日本旅客鉄道</ref>。宇部新川駅 - 小野田駅間でワンマン運転開始<ref name="kotsu_2011" /><ref>{{Cite book|和書 |date=1992-07-01 |title=JR気動車客車編成表 '92年版 |chapter=JRワンマン運転線区一覧表 |page=192 |publisher=ジェー・アール・アール |ISBN=4-88283-113-9}}</ref>。
* [[2002年]](平成14年)[[3月23日]]:深夜時間帯の列車<ref name="2002年1月号" >交通新聞社 JR時刻表 2002年1月号</ref>が廃止。
* [[2003年]](平成15年)[[3月14日]]:雀田駅 - 長門本山駅間のクモハ42形電車の運行をこの日限りで終了{{R|JRR2003}}<ref name="jrw_20021220" />。
* [[2009年]](平成21年)6月1日:組織改正により宇部新川鉄道部が廃止され、小野田駅構内も含めて同日発足の[[山口地域鉄道部]]の管轄になる<ref>[https://web.archive.org/web/20090525094929/http://www.westjr.co.jp/news/newslist/article/1174240_799.html 「山口地域鉄道部」新設に伴う組織改正について](インターネット・アーカイブ)- 西日本旅客鉄道プレスリリース 2009年5月18日</ref>。
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2021年3月13日改正時点の運行形態は次の通り<ref>『JTB時刻表』2021年3月号、[[JTBパブリッシング]]。</ref>。
 
居能駅 - 小野田駅間の本線では全列車が[[宇部線]]居能駅 - [[宇部新川駅]]間に乗り入れ、途中駅発着の列車はなく、宇部新川駅 - 雀田駅 - 長門本山駅間に運転される本山支線の送り込みを除く全列車が小野田駅 - 宇部新川駅間で9往復運転されている。土休日はこのうち上り2本が宇部線経由で新山口駅まで運転される。2021年3月13日以前は、宇部新川発小野田行の終電が21時台、小野田発宇部新川行の終電が22時台に運行されていたが、改正以後は繰り上げられてそれぞれ19時台、20時台となり、運行本数が1桁台になった。2002年1月時点では宇部新川発の最終は22時半まであった。<ref name="2002年1月号" />
 
雀田駅 - 長門本山駅間の本山支線は朝6・7時台に2往復・夕方18時台に1往復の計1日3往復のみの運転で、朝6時台の下り始発が宇部新川発、朝7時台の下り2本目と夕方18時台の上り最終列車が宇部新川行きで運転されている<ref>{{Cite web |url=https://www.sankei.com/article/20231221-55ISL6WOKNKIJFRCAXNM4C5MUY/ |title=石炭輸送でにぎわいの駅 今は1日3往復で希少価値 長門本山駅 |publisher=産経新聞 |date=2023-12-21 |accessdate=2023-12-21}}</ref>。かつては通学客のため土曜日の日中も1往復運転されていたほか、夜間にも運転されていた<ref name="2002年1月号" />が、2002年3月23日のダイヤ改正で2002年度<!--4月-->から[[学校週5日制]]が実施されることにより日中の運転はなくなり、朝夕も削減されて夜間の運転がなくなった。さらに2012年3月17日のダイヤ改正では夕方16-17時台の2往復が廃止されて1日3往復運転となった<ref>{{PDFlink|[http://www.westjr.co.jp/press/article/items/20111216_hiroshima.pdf 平成24年春ダイヤ改正について]}} - 西日本旅客鉄道広島支社プレスリリース 2011年12月16日</ref>。
 
全列車が[[ワンマン運転]]を行っている。