Bluth realizza nel 1997 [[Anastasia (film 1997)|''Anastasia'']], prodotto dalla Fox Animation Studios, che incassa 186 milioni di dollari in tutto il mondo, ottiene ottimi giudizi dalla critica e viene nominato in varie categorie agli [[Annie Award]]s dell'anno regalando a Bluth, oltre a una nomination per il miglior regista di un film d'animazione, una nuova giovinezza artistica. Nonostante il successo ottenuto con [[Anastasia (film 1997)|''Anastasia'']], il film successivo, ''[[Titan A.E.]]'' (2000), si rivela un grosso fallimento al botteghino (costato 75 milioni di dollari ne incassa globalmente 37) e ottiene critiche contrastanti; e questo è, fatta eccezione per ''[[I Simpson - Il film]]'' (2007), l'ultimo film d'animazione tradizionale ad essere stato distribuito dalla Fox Animation Studios.
===Il terzo millennio ===
Nel 2002, Bluth e la compagnia di videogiochi [[Ubisoft]] realizzano il videogioco ''Dragon's Lair: Return to the Lair'', che si ispira all'originale del 1983. Il prodotto ottiene critiche miste, con gruppi di persone che apprezzano e stroncano assieme i controlli e la storia. Nel 2007 annuncia insieme al collega Gary Goldman di progettare un film ispirato alle avventure di ''Dragon's Lair'', ma il progetto aspetta ancora un finanziamento per essere realizzato.
Nel 2009 collabora in qualità di attore nel film documentario ''Il risveglio della magia'', dove racconta la storia della Disney tra la realizzazione di [[Red e Toby nemiciamici|''Red e Toby'']] fino all'uscita de [[Il re leone|''Il re Leone'']] nel 1994, per molti considerato il film per eccellenza del rinascimento disneyano. Nel 2011 ''Anastasia'' viene distribuito in formato Blu-ray Disc e il grande successo di vendite che segue riporta il grande pubblico ad avere interesse per i lavori di Bluth.
Negli ultimi anni, oltre ad aver pubblicato due libri su come realizzare un film d'animazione, Bluth ha aperto inoltre un sito web personale, DonBluthAnimation.com, dove tiene lezioni di animazione attraverso video tutorial, cortometraggi e lezioni live.
