Nel 2012 viene indagato nell'inchiesta "spese pazze" legata all'uso dei fondi destinati ai gruppi consiliari regionali, durante il mandato di consigliere regionale nel periodo 2008-2012.<ref>{{Cita news|lingua=it|url=http://ricerca.gelocal.it/gazzettadimantova/archivio/gazzettadimantova/2012/12/16/NZ_02_C.html|titolo=Via agli interrogatori per i 40 indagati La Minetti tra i primi a finire davanti ai pm - Gazzetta di Mantova|pubblicazione=Archivio - Gazzetta di Mantova|accesso=2018-09-08}}</ref><ref>{{Cita news|lingua=it|url=http://ricerca.repubblica.it/repubblica/archivio/repubblica/2018/02/15/il-riciclato-leconomista-fallito-e-quelli-delle-spese-pazze-salvini06.html|titolo=Il riciclato, l'economista fallito e quelli delle spese pazze Gli impresentabili di Salvini - la Repubblica.it|pubblicazione=Archivio - la Repubblica.it|accesso=2018-09-08}}</ref>
Il 16 maggio 2014, prima della sentenza della [[Corte dei conti]], ha restituito 49 mila euro, riconducibili all'acquisto di pranzi e cene con i fondi destinati ai gruppi consiliari.<ref>{{Cita news|lingua=it-IT|url=https://www.ilfattoquotidiano.it/2014/07/31/regione-lombardia-spese-pazze-prima-condanna-della-corte-di-conti/1078064/|titolo=Regione Lombardia, spese pazze. Prima condanna della Corte di Conti - Il Fatto Quotidiano|pubblicazione=Il Fatto Quotidiano|data=2014-07-31|accesso=2018-09-08}}</ref>
Il 29 aprile 2015 viene rinviato a giudizio per peculato.<ref>{{Cita news|url=http://rho.milanotoday.it/fabrizio-cecchetti-rinviato-giudizio-29-aprile-2015.html|titolo=Spese pazze al Pirellone: rinviato a giudizio anche Fabrizio Cecchetti|pubblicazione=MilanoToday|accesso=2018-09-08}}</ref>
