Nel [[1954]], dopo l'addio alla Nazionale di [[Vsevolod Bobrov]], Netto divenne capitano del team sovietico<ref>{{Cita web|url=http://eu-football.info/_match.php?id=14519|titolo=Soviet Union football team defeated Sweden 7:0, 8 September 1954|lingua=en|accesso=13 aprile 2014}}</ref>. L'anno dopo, il 16 settembre in amichevole contro l'{{NazNB|CA|IND}} (battuta 11-1), Netto realizzò il primo gol con la maglia della Nazionale.<ref>{{Cita web|url=http://eu-football.info/_match.php?id=14601|titolo=Soviet Union national team v India, 16 September 1955|lingua=en|accesso=13 aprile 2014}}</ref> Nel 1956, ai [[Giochi della XVI Olimpiade|Giochi Olimpici]] di [[Melbourne]], la sua squadra vinse la medaglia d'oro battendo in finale per 1-0 la Jugoslavia. L'impresa valse a Netto e agli altri olimpionici nel [[1957]] l'onorificenza dell'[[Ordine di Lenin]], la più grande decorazione sovietica, per il contributo allo sport nazionale.<ref name=times/>
Nel [[1958]] Netto prese parte aial [[Campionato mondiale di calcio 1958|MondialiMondiale di Svezia]], ma a causa di un grave infortunio a un ginocchio<ref>{{cita web|http://russiateam.com/legends/yashin.html |Lev YASHIN |13 ottobre 2017 |lingua=en}}</ref> giocò solo la partita della prima fase persa per 2-0 contro il {{NazNB|CA|BRA}} di [[Pelé]].<ref name=sr>{{cita web|url= http://www.sports-reference.com/olympics/athletes/ne/igor-netto-1.html |titolo= Igor Netto | accesso= 15 ottobre 2017 |lingua= en |urlarchivio= https://web.archive.org/web/20140306090306/http://www.sports-reference.com/olympics/athletes/ne/igor-netto-1.html |dataarchivio= 6 marzo 2014 |editore= sports-reference.com |urlmorto= no }}</ref> Nella [[Campionato europeo di calcio 1960|prima edizione]] del [[Campionato europeo di calcio]] nel [[1960]] fu il capitano della squadra che vinse il torneo battendo in finale la Jugoslavia per 2-1 dopo i tempi supplementari. Alla fine del torneo circolò la voce di un suo passaggio al Real Madrid. I giocatori che vinsero il titolo europeo e l'Olimpiade sono conosciuti come la generazione d'oro del calcio sovietico, tra i suoi compagni più forti vi erano il grande portiere [[Lev YashinJašin|YashinJašin]] e l'attaccante [[Valentin Koz'mič Ivanov|Ivanov]].<ref name=times/>
Nel [[1962]], aial [[Campionato mondiale di calcio 1962|mondialimondiale cilenicileno]], i sovietici con Netto terminarono il girone finendo a pari punti con l'Inghilterra e passarono il turno sconfiggendola nello spareggio. Furono quindi eliminati nei quarti di finale dal {{NazNB|CA|CHL}}. L'anno seguente Netto fece la sua penultima apparizione in Nazionale, mentre l'ultima presenza fu nell'incontro pareggiato 0-0 con l'{{NazNB|CA|AUT}} il 16 maggio [[1965]]; chiuse la carriera con la maglia dell'URSS dopo 54 partite e 4 gol.<ref name=sr/>
