L'area del [[Nuovo Messico]] in cui viveva ''Zuniceratops'' è un'area ricca di fossili. La documentazione fossile della Formazione Moreno Hill documenta un periodo di transizione tra la fauna del [[Cretaceo inferiore]] e la fauna del [[Cretaceo superiore]]. L'area era una regione costiera coperta da fitte foreste dal clima umido. ''Zuniceratops'' condivideva il suo habitat con il [[Tyrannosauroidea|tyrannosauroide]] ''[[Suskityrannus]]'', il [[Therizinosauria|therizinosauro]] ''[[Nothronychus]]'', e l'[[Hadrosauridae|hadrosauro]] ''[[Jeyawati rugoculus|Jeyawati]]''.<ref>{{CiteCita journalpubblicazione|lastcognome=Lucas|firstnome=S.G.|last2cognome2=Heckert|first2nome2=A.B.|datedata=2000|titletitolo=Cretaceous Dinosaurs in New Mexico|url=https://libres.uncg.edu/ir/asu/f/Heckert_A_2000_17_Cretaceous_Dinosaurs.pdf|journalrivista=Dinosaurs of New Mexico, New Mexico Museum of Natural History and Science Bulletin|publishereditore=New Mexico Museum of Natural History and Science|volume=17|pagespp=83–90|via=}}</ref><ref>{{citeCita web|url=https://paleobiodb.org/classic/checkTaxonInfo?taxon_no=66508&is_real_user=1|titletitolo=''Nothronychus mckinleyi''|lastcognome=|firstnome=|datedata=|websitesito=The Paleobiology Database|archive-urlurlarchivio=|archive-date=|access-dateaccesso=}}</ref><ref>{{citeCita web|url=https://paleobiodb.org/classic/checkTaxonInfo?taxon_no=66590&is_real_user=1|titletitolo=''Zuniceratops''|lastcognome=|firstnome=|datedata=|websitesito=The Paleobiology Database|archive-urlurlarchivio=|archive-date=|access-dateaccesso=}}</ref><ref>{{citeCita news|url=http://discovermagazine.com/2001/aug/featzuni|titletitolo=The Creature From the Zuni Lagoon|lastcognome=Pringle|firstnome=H.|datedata=1º Augustagosto 2001|workopera=Discover|accessdateaccesso=6 Maymaggio 2019|last2cognome2=Delin|first2nome2=G.|issuenumero=AUGUST 2001}}</ref> La formazione contiene anche un [[Ankylosauridae|ankylosauride]] attualmente non descritto.<ref>{{cite journalCita pubblicazione|author1autore1=Sterling J. Nesbitt | author2autore2=Robert K. Denton Jr | author3autore3=Mark A. Loewen | author4autore4=Stephen L. Brusatte |author5autore5=Nathan D. Smith |author6autore6=Alan H. Turner |author7autore7=James I. Kirkland |author8autore8=Andrew T. McDonald |author9autore9=Douglas G. Wolfe |yearanno=2019 |titletitolo=Supplementary information for: A mid-Cretaceous tyrannosauroid and the origin of North American end-Cretaceous dinosaur assemblages |journalrivista=Nature Ecology & Evolution |volume=3 |issuenumero= 6|pagespp= 892–899|url=https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41559-019-0888-0/MediaObjects/41559_2019_888_MOESM1_ESM.pdf | doi=10.1038/s41559-019-0888-0 | pmid=31061476 }}</ref> Nella stessa località sono stati ritrovati anche resti fossili di [[coccodrilli]] ed una possibile tartaruga marina appartenente a [[Cheloniidae]].<ref name="paleobiodb.org">{{citeCita web|titletitolo=Mirror Mesa (MSM) (Cretaceous of the United States) |url=https://paleobiodb.org/classic/basicCollectionSearch?collection_no=52360 |websitesito=PBDB}}</ref>
