Il 13 settembre del [[2000]] un violentoviolentissimo cataclisma colpisce l'[[Antartide]], causando il completo scioglimento della calotta australe e di conseguenza una notevole variazione di nell'inclinazione nelldell'asse terrestre. I successivi cambiamenti climatici, l'innalzamento del livello del mare e lo scatenarsi di conflitti globali per aggiudicarsi le poche risorse rimanenti portano alla morte di circa tre miliardi di persone. L'esplosione, denominata ''[[Glossario di Neon Genesis Evangelion#Second Impact|Second Impact]]'', secondoviene laappunto versioneattribuita ufficiale è stata determinata dalloallo schianto di un poderoso [[meteorite]] con ilsul [[polo sud]]. La vera causa della catastrofe, peròinvece, è da ricercarsi in un fallimentare esperimento eseguito da un gruppo di scienziati su di un colossale essere umanoide chiamato [[Angeli (Neon Genesis Evangelion)#Adam|Adam]], primo di una serie di misteriosi nemici conosciuti come [[Angeli (Neon Genesis Evangelion)|angeli]]. L'esperimento viene condotto da un team di ricerca guidato dal dottor Katsuragi, dietro cui si cela un'organizzazione chiamata [[Glossario di Neon Genesis Evangelion#Seele|Seele]] e il suo enigmatico [[Glossario di Neon Genesis Evangelion#Progetto per il perfezionamento dell'uomo|Progetto per il perfezionamento dell'uomo]]. Per realizzare il piano viene istituito un centro di ricerca chiamato [[Glossario di Neon Genesis Evangelion#Gehirn|Gehirn]], il cui scopo principale è quello di sviluppare contromisure adeguate contro gli attacchi di ulteriori angeli, previsti in alcuni documenti noti come [[Glossario di Neon Genesis Evangelion#Pergamene del Mar Morto|pergamene del Mar Morto]]. Vedono così la luce gli enormi umanoidi artificiali [[Evangelion (mecha)|Evangelion]], i tre supercomputer [[Glossario di Neon Genesis Evangelion#Magi System|Magi]] e la città di Neo Tokyo-3. L'organizzazione, portati a termine i propri compiti, viene rinominata Nerv e, sotto la guida di [[Gendō Ikari]], viene incaricata di contrastare l'imminente attacco degli angeli.