SARS-CoV-2: differenze tra le versioni
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Gli esperimenti di modellizzazione delle proteine sulla proteina S del virus hanno suggerito che SARS-CoV-2 ha affinità con i recettori dell'[[enzima 2 di conversione dell'angiotensina]] (ACE2) delle cellule umane per usarle come "porta" di entrata nella cellula.<ref>{{Cita pubblicazione|coautori= Xu X, Chen P, Wang J, Feng J, Zhou H, Li X, Zhong W, Hao P |titolo= Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission |rivista= Science China Life Sciences |volume= 63 |numero= 3 |pp= 457-460 |data= marzo 2020 | pmid = 32009228 | doi = 10.1007/s11427-020-1637-5 }}</ref>
Al 22 gennaio 2020, un gruppo cinese che lavorava con il genoma virale completo e un gruppo statunitense che utilizzava metodi di genetica inversa, hanno dimostrato indipendentemente che ACE2 era in grado di agire da recettore per SARS-CoV-2.<ref name="NatureZhou" /><ref name="Letco22Jan2020">{{Cita pubblicazione|coautori=Letko M, Munster V|titolo=Functional assessment of cell entry and receptor usage for lineage B β-coronaviruses, including 2019-nCoV|data=gennaio 2020 |rivista=[[bioRxiv]] |tipo=preprint |doi=10.1101/2020.01.22.915660 }}</ref><ref>{{Cita pubblicazione|coautori= Letko M, Marzi A, Munster V |titolo= Functional assessment of cell entry and receptor usage for SARS-CoV-2 and other lineage B betacoronaviruses |rivista= Nature Microbiology |data= febbraio 2020 | pmid = 32094589 | doi = 10.1038/s41564-020-0688-y }}</ref><ref>{{Cita pubblicazione|coautori=((El Sahly HM))|titolo=Genomic Characterization of the 2019 Novel Coronavirus |url=https://www.jwatch.org/na50823/2020/02/06/genomic-characterization-2019-novel-coronavirus |rivista=[[The New England Journal of Medicine]] |accesso=9 febbraio 2020}}</ref><ref name="Gralinski2020">{{Cita pubblicazione|coautori= Gralinski LE, Menachery VD |titolo= Return of the Coronavirus: 2019-nCoV |rivista= Viruses |volume= 12 |numero= 2 |p= 135 |data= gennaio 2020 | pmid = 31991541 | doi = 10.3390/v12020135 }}</ref><ref>{{Cita pubblicazione|coautori= Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H, Wang W, Song H, Huang B, Zhu N, Bi Y, Ma X, Zhan F, Wang L, Hu T, Zhou H, Hu Z, Zhou W, Zhao L, Chen J, Meng Y, Wang J, Lin Y, Yuan J, Xie Z, Ma J, Liu WJ, Wang D, Xu W, Holmes EC, Gao GF, Wu G, Chen W, Shi W, Tan W |titolo= Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding |rivista= [[The Lancet]] |volume= 395 |numero= 10224 |pp= 565-574 |data= febbraio 2020 | pmid = 32007145 | doi = 10.1016/S0140-6736(20)30251-8 }}</ref> Gli studi hanno dimostrato che il SARS-CoV-2 ha un'affinità più elevata con ACE2 umano rispetto al [[SARS-CoV]].<ref name="SCI-20200219">{{Cita pubblicazione|coautori= Wrapp D, Wang N, Corbett KS, Goldsmith JA, Hsieh CL, Abiona O, Graham BS, McLellan JS |titolo= Cryo-EM structure of the 2019-nCoV spike in the prefusion conformation |rivista= Science |volume= 367 |numero= 6483 |pp= 1260-1263 |data= febbraio 2020 | pmid = 32075877 | doi = 10.1126/science.abb2507 | bibcode = 2020Sci...367.1260W }}</ref>
[[File:Rappresentazione schematica spinula del SARS-CoV-2.png|Rappresentazione schematica della proteina S con la descrizione delle [[subunità]] S1, S2 e S2'.<br/>
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Come le proteine di fusione di molti altri virus, la proteina S è attivata da [[proteasi]] cellulari presenti sulla superficie delle cellule umane. L'attivazione di tale proteina del SARS-CoV-2 è un processo che richiede il taglio proteolitico in due distinti punti, S1/S2 e S2', che separa le due subunità S1 e S2 che però rimangono unite non covalentemente<ref>{{Cita pubblicazione|nome=Berend Jan|cognome=Bosch|nome2=Willem|cognome2=Bartelink|nome3=Peter J. M.|cognome3=Rottier|data=2008-9|titolo=Cathepsin L Functionally Cleaves the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus Class I Fusion Protein Upstream of Rather than Adjacent to the Fusion Peptide|rivista=Journal of Virology|volume=82|numero=17|pp=8887-8890|accesso=26 novembre 2020|doi=10.1128/JVI.00415-08|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2519682/}}</ref><ref>{{Cita pubblicazione|nome=Sandrine|cognome=Belouzard|nome2=Victor C.|cognome2=Chu|nome3=Gary R.|cognome3=Whittaker|data=7 aprile 2009|titolo=Activation of the SARS coronavirus spike protein via sequential proteolytic cleavage at two distinct sites|rivista=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|volume=106|numero=14|pp=5871-5876|accesso=26 novembre 2020|doi=10.1073/pnas.0809524106|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2660061/}}</ref>. I tagli sono dovuti a due proteine presenti sulla membrana della cellula ospite, al punto S1/S2 tramite la [[Furina (enzima)|furina]], una proteina transmembrana che normalmente catalizza il rilascio di proteine mature a partire da precursori, e al punto S2' tramite la serina proteasi 2 transmembranica ([[TMPRSS2]]), il cui ruolo fisiologico è tuttora ignoto<ref>{{Cita pubblicazione|nome=Dorothea|cognome=Bestle|nome2=Miriam Ruth|cognome2=Heindl|nome3=Hannah|cognome3=Limburg|data=23 luglio 2020|titolo=TMPRSS2 and furin are both essential for proteolytic activation of SARS-CoV-2 in human airway cells|rivista=Life Science Alliance|volume=3|numero=9|accesso=29 aprile 2021|doi=10.26508/lsa.202000786|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7383062/}}</ref>. Il taglio al sito S2' appena sopra il peptite idrofilo di fusione sembra sia responsabile dell'inizio del attività di fusione membranica<ref>{{Cita pubblicazione|nome=Ikenna G.|cognome=Madu|nome2=Shoshannah L.|cognome2=Roth|nome3=Sandrine|cognome3=Belouzard|data=2009-8|titolo=Characterization of a Highly Conserved Domain within the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus Spike Protein S2 Domain with Characteristics of a Viral Fusion Peptide|rivista=Journal of Virology|volume=83|numero=15|pp=7411-7421|accesso=26 novembre 2020|doi=10.1128/JVI.00079-09|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2708636/}}</ref><ref>{{Cita pubblicazione|nome=Alexandra C.|cognome=Walls|nome2=M. Alejandra|cognome2=Tortorici|nome3=Berend-Jan|cognome3=Bosch|data=2016|titolo=Cryo-electron microscopy structure of a coronavirus spike glycoprotein trimer|rivista=Nature|volume=531|numero=7592|pp=114-117|accesso=26 novembre 2020|doi=10.1038/nature16988|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5018210/}}</ref>. In seguito al taglio si ha lo sbloccaggio del peptide di fusione (PF) che a questo punto si protende per fondersi alla [[membrana cellulare]].
Una variante della proteina S originale di Wuhan, nota come D614G già individuata nei primi mesi del 2020 ha iniziato a prendere piede in Europa per poi diffondersi successivamente in [[Nord America]], [[Oceania]] e [[Asia]] per diventare progressivamente a partire da marzo la più diffusa al mondo<ref name="cell.com">{{Cita pubblicazione|nome=Bette|cognome=Korber|nome2=Will M.|cognome2=Fischer|nome3=Sandrasegaram|cognome3=Gnanakaran|data=20 agosto 2020|titolo=Tracking Changes in SARS-CoV-2 Spike: Evidence that D614G Increases Infectivity of the COVID-19 Virus|rivista=Cell|volume=182|numero=4|pp=812–827.e19|lingua=en|accesso=24 novembre 2020|doi=10.1016/j.cell.2020.06.043|url=https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(20)30820-5}}</ref>. Tale mutazione derivata da una [[Mutazione genetica|mutazione missenso]] nel gene codificante la proteina S, risultante nel cambio di un amminoacido [[aspartato]] a una [[glicina]] nella posizione 614<ref>{{Cita pubblicazione|nome=Sandra|cognome=Isabel|nome2=Lucía|cognome2=Graña-Miraglia|nome3=Jahir M.|cognome3=Gutierrez|data=20 agosto 2020|titolo=Evolutionary and structural analyses of SARS-CoV-2 D614G spike protein mutation now documented worldwide|rivista=Scientific Reports|volume=10|numero=1|p=14031|lingua=en|accesso=24 novembre 2020|doi=10.1038/s41598-020-70827-z|url=https://www.nature.com/articles/s41598-020-70827-z}}</ref>. Nonostante la variante D614G presenti una morfologia e capacità neutralizzante simile alla variante di Wuhan, la prevalsa sul ceppo iniziale è stata spiegata in esperimenti ''[[in vitro]]'' en ''[[in vivo]]'' con un'aumentata [[Affinità (biochimica)|affinità]] per l'ACE2 della cellula ricevente, aumentata replicazionne e trasmissione<ref>{{Cita pubblicazione|nome=Bin|cognome=Zhou|nome2=Tran|cognome2=Thi Nhu Thao|nome3=Donata|cognome3=Hoffmann|data=26 febbraio 2021|titolo=SARS-CoV-2 spike D614G change enhances replication and transmission|rivista=Nature|pp=1-8|lingua=en|accesso=4 marzo 2021|doi=10.1038/s41586-021-03361-1|url=https://www.nature.com/articles/s41586-021-03361-1}}</ref><ref>{{Cita pubblicazione|nome=Yixuan J.|cognome=Hou|nome2=Shiho|cognome2=Chiba|nome3=Peter|cognome3=Halfmann|data=12 novembre 2020|titolo=SARS-CoV-2 D614G variant exhibits efficient replication ex vivo and transmission in vivo|rivista=Science|lingua=en|accesso=24 novembre 2020|doi=10.1126/science.abe8499|url=https://science.sciencemag.org/content/early/2020/11/11/science.abe8499}}</ref>. La variante D614G oltre al cambio nella posizione 614 è accompagnata nella maggior parte dei casi da altre 3 mutazioni ed è stata considerata dall'agosto 2020 la forma mondiale dominante<ref name="cell.com"/>.
Dovuto alla rilevanza della proteina S nell'attacco alle cellule ospiti per la proliferazione del virus, una pressione selettiva continua causata da persone immunizzare naturalmente o tramite vaccinazione ha portato a far prevalere la diffusione di varianti virali con modifiche nella sequenza di questa proteina. Questo ha portato a riscontrare
=== Persistenza del virus ===
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