È la più grave delle tre ruggini che colpisce il frumento. La ruggine nera, è una malattia che colpisce tardivamente, verso l'inizio di giugno, perdate le sue elevate esigenze termiche,; infatti ha un optimum di temperatura di 20 gradi. Si manifesta susulle foglie, sulle glume e sui culmi sotto la forma di pustole color ruggine e piùsoprattutto con pustole bruno-nere,; le pustole sono disposte in forma longitudinale e seguono le nervature delle foglia (deriva proprio da qui il nome ruggine lineare). La pianta con il tempo dissecca.