Grazie alla nuova ''Tuta DPP'' che sfrutta il Phazon nel suo corpo, Samus è in grado di entrare in uno stato di potenziamento chiamato ''Iperfase''. Per entrare in Iperfase, bisogna utilizzare un intero serbatoio energeticod'energia. In compenso, Samus diventa estremamente potente e generausa il Phazon chenel vienesuo emessocorpo come arma sotto forma didell'Iper raggioRaggio. Una volta in questo stato compare una barra d'energia diversa dal solito, che sta ad indicare la quantità di Phazon rimasto. Quando la barra è a zero, si esce dall'Iperfase, anche se,ma dopo venticinque secondi, un sistema di sicurezza la disattiva automaticamente. L'usoSe eccessivorimane per troppo tempo in Iperfase o viene colpita da una granata di questoPhazon poterelanciata porteràda un Pirata Spaziale, entrerà in Iperfase corrotta a causa di un sovraccarico di energia,Phazon che non permette di uscire dall'Iperfase e la costringe Samus ad espellere il Phazon in continuazioneeccesso energiafinché alnon esce dall'Iperfase, altrimenti cederà alla contaminazione da Phazon, risultando nella Contaminazione Totale e in un Game Over.
