Marshall Applewhite nacque a [[Spur (Texas)|Spur]], in [[Texas]], il 17 maggio [[1931]] da Marshall Applewhite Sr., un [[presbiterianesimo|pastore presbiteriano]], e Louise Winfield. IlDa padrepiccolo eraricevette ununa [[presbiterianesimo|pastorerigida presbiteriano]]educazione da parte del padre, che lo educòvoleva rigidamenteindirizzare allaverso la religione. DuranteNegli laanni della sua adolescenza frequentò la Corpus Christi High School e la Austin College; in quest'ultima in particolare fu attivo in diverse organizzazioni studentesche. Nel [[1952]] si laureò in filosofia, dopodiché si iscrisse alla Union Presbyterian Seminary, un seminario a sfondo teologico. In quel periodo conobbe e sposò Anne Pearce, da cui ebbe due figli. Poco tempo dopo decise di lasciare il seminario per dedicarsi all'insegnamento musicale, diventando direttore del coro di una chiesa presbiteriana della [[Carolina del Nord]]. Nel [[1954]] si arruolò nell'esercito statunitense e prestò servizio in [[Austria]] e nel [[Nuovo Messico]] come membro dei [[Signal Corps (United States Army)|corpi di comunicazione]]. Lasciò l'esercito due anni dopo e si iscrisse all'Università del [[Colorado]], dove conseguì un master in musica.
In seguito si trasferì a [[New York]] nel tentativo infruttuoso di lanciarsi come cantante al termine della sua formazione istruttiva nel [[Colorado]]. Dopo aver insegnato per un breve periodo all'[[Università dell'Alabama]], da cui venne cacciato dopo essere stato accusato di averabusi abusatosessuali sessualmenteai danni di uno studente (motivo per il quale la moglie divorziò dopo essere venuta a conoscenza della vicenda), si trasferì a [[Houston]] nel [[1965]] per insegnare alla University of St. Thomas. Si ritirò in seguito dall'università a seguito di problemi che riguardavano un presunto malessere emotivo, anche se alcuni sociologi ipotizzarono che il motivo di tale decisione potesse centrare con un'altra relazione che Applewhite ebbe con uno studente dell'istituto. Nel [[1971]] si trasferì per un breve periodo nel [[Nuovo Messico]], dove gestì una salumeria. Dopo la morte del padre, avvenuta in quello stesso anno, Applewhite subì un forte impatto emotivo e cadde in depressione.