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Dopo diverse esperienze nei settori giovanili e femminili romagnoli, a partire dalla stagione 2018<ref>{{Cita web|url=https://www.fsgc.sm/femminile-prima-squadra-presentato-il-nuovo-tecnico-alain-conte/|titolo=Femminile, prima squadra: presentato il nuovo tecnico Alain Conte|sito=fsgc.sm|data=11 luglio 2018|accesso=26 giugno 2020}}</ref> Alain Conte diventa allenatore della [[San Marino Academy]] femminile. Al termine della [[Serie_C_2018-2019_(calcio_femminile)|stagione 2018-2019]] la squadra vince il girone C di Serie C davanti al [[Unione Sportiva Città di Pontedera|Pontedera]] allenato da [[Renzo Ulivieri]] e il [[Associazione Calcistica Perugia Calcio|Perugia]], qualificandosi per la finale spareggio. Lo spareggio per la promozione si disputa allo [[Stadio Il Noce|Stadio "il Noce" di Noceto]] il 5 maggio 2019 contro la [[Riozzese]]. Le Titane vincono 2 a 0 grazie alle reti di Francesca Lanotte e Yesica Soledad Menin e salgono in [[Serie_B_(calcio_femminile)|Serie B]], per la prima volta nella loro storia in un girone unico nazionale.
Nella [[Serie_B_2019-2020_(calcio_femminile)|stagione successiva]] la squadraSan dellaMarino Repubblica Sammarinese di Conte,Academy si laurea campione d'inverno e nella stessa stagione accede ai quarti di finale di [[Coppa_Italia_(calcio_femminile)|Coppa Italia]], unica squadra di Serie B a farlo, battendo agli ottavi di finale in gara unica a San Marino per 1 a 0 l'[[Women Hellas Verona|Hellas Verona]] allenata da [[Emiliano Bonazzoli]] (squadrain militantegara nelunica campionatoa diSan SerieMarino A)per 1 a 0. Ai quarti di finale affronta la [[Associazione Sportiva Roma (femminile)|Roma]] in una sfida di andata e ritorno, che vede prevalere la squadra giallorossa (1-6 allo stadio Acquaviva di San Marino e 4-0 a Roma). La stagione viene però interrotta il 9 Marzomarzo 2020 a causa della pandemia di [[COVID-19|Covid19]], conquando lela TitaneSan Marino Academy era al terzo posto in terzeclassifica dietro a [[Napoli Femminile|Napoli]] e [[Società_Sportiva_Lazio_Women_2015|Lazio]], ma con una partita in meno rispetto alla squadra bianco celeste. Il campionato non riprende e la [[Federazione Italiana Giuoco Calcio|FIGC]] decide di chiudere la stagione assegnando i risultati attraverso l'applicazione di un "algoritmo" che premia per pochi decimali la squadra di Conte che viene promossa in Serie A per la prima volta nella sua storia<ref>{{Cita web|url=https://www.sanmarinoacademy.sm/femminile-ora-e-ufficiale-le-titane-sono-in-serie-a/|titolo=Femminile, ora è ufficiale: le Titane sono in Serie A|sito=sanmarinoacademy.sm|data=25 giugno 2020|accesso=3 novembre 2023}}</ref><ref>{{Cita web|url=https://metropolitanmagazine.it/san-marino-academy-serie-a/|titolo=San Marino Academy: sarà Serie A per la prima volta|sito=metropolitanmagazine.it|data=12 giugno 2020|accesso=3 novembre 2023}}</ref>.
Grazie alla promozione nella massima serie italiana di calcio femminile, Conte viene ammesso di diritto al corso allenatori professionisti [[Licenza UEFA A|UEFA A]] di [[Centro_Tecnico_Federale_Luigi_Ridolfi|Coverciano]], al termine del quale ottiene anche un riconoscimento per il risultato raggiunto<ref>{{Cita web|url=https://www.figc.it/it/tecnici/news/ufficializzati-i-nuovi-allenatori-uefa-a-tra-gli-abilitati-molti-nomi-noti-del-calcio-italiano-07-07-2021/|titolo=Ufficializzati i nuovi allenatori UEFA A. Tra gli abilitati molti nomi noti del calcio italiano|sito=figc.it|data=7 luglio 2021|accesso=3 novembre 2023}}</ref>.
Ad aprile 2021 viene insignito della [[Panchina d'oro|Panchina d'argento per il calcio femminile]] per la stagione 2019-2020, il riconoscimento che gli allenatori rilasciano ai colleghi che si sono contraddistinti nella stagione precedente. A causa della pandemia ancora in atto però, la cerimonia non viene svolta come di consueto nell'Aula Magna di Coverciano, ma è lo stesso presidente del [[Settore Tecnico]] della Federazione Italiana Giuoco Calcio [[Demetrio Albertini]] a consegnare il premio al [[San Marino Stadium]]<ref>{{Cita web|url=https://www.ilrestodelcarlino.it/rimini/sport/mister-conte-si-accomoda-sulla-panchina-d-argento-1.6193569|titolo=Mister Conte si accomoda sulla ’Panchina d’argento’|sito=ilrestodelcarlino.it|data=31 marzo 2021|accesso=3 novembre 2023}}</ref><ref>{{Cita web|url=https://www.figc.it/it/tecnici/news/il-settore-tecnico-incorona-i-migliori-allenatori-del-calcio-femminile-premiati-piovani-e-alain-conte-19-04-2021/|titolo=Il Settore Tecnico incorona i migliori allenatori del calcio femminile: premiati Piovani e Alain Conte|sito=figc.it|data=19 aprile 2021|accesso=3 novembre 2023}}</ref>.
Al termine della stagione [[Serie_A_2020-2021_(calcio_femminile)|2020-2021]] (prima e finora unica stagione nel massimo campionato italiano femminile), la San Marino Academy retrocede in serie B all'ultima giornata, con la sconfitta subita allo stadio di Acquaviva contro la [[ACF Fiorentina (femminile)|Fiorentina]] per 2 a 1.
In accordo con la società, non rinnova il suo contratto e per la stagione [[Serie_A_2021-2022_(calcio_femminile)|2021-2022]] viene sostituito da Alessandro Recenti, che però alla quinta giornata si dimette. La San Marino Academy allora richiama Conte il 14 ottobre 2021. Esordisce nuovamente con la squadra biancoazzurra in [[Coppa_Italia_2021-2022_(calcio_femminile)|Coppa Italia]], vincendo 1 a 0 in trasferta contro la [[Pro Sesto 1913#Sezione_femminile|Pro Sesto]]. Al termine di quella stagione la squadra sammarinese si piazzeràè classificata terza con 44 punti dietro a [[F.C. Como Women|Como]] (promosso in serie A) e [[A.C.F. Brescia Calcio Femminile|Brescia]]. Conte raggiunge alla penultima giornata di campionato, proprio in casa della Pro Sesto, le 50 vittorie su 95 partite sulla panchina biancoazzurra, ma a fine stagione non viene comunque riconfermato. La San Marino Accademy decide infatti di sostituire sia l'allenatore romagnolo che il [[direttore sportivo]] Ivan Zannoni<ref>{{Cita web|url=https://www.ilrestodelcarlino.it/rimini/sport/si-dividono-le-strade-dellacademy-e-del-ds-zannoni-1.7590914|titolo=Si dividono le strade dell’Academy e del ds Zannoni|sito=ilrestodelcarlino.it|data=22 aprile 2022|accesso=3 novembre 2023}}</ref>, entrambi protagonisti della doppia promozione per la squadra di [[San Marino]].
==== Cesena ====
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