Cresce in Brasile nei settori giovanili di Goianense{{Calcio Atletico Goianiense|N}}, Andraus e {{Calcio Santo André|N}}. Proprio con il Santo André debutta anche in prima squadra.
La dirigenza degli svedesi dell'[[Allmänna{{Calcio Idrottsklubben FotbollAIK|AIK]]N}} mise gli occhi su di lui, portandolo in Scandinavia nell'estate del 2009, a meno di tre mesi dalla fine del campionato. Il suo primo gol con la nuova maglia lo realizza contro l'Häcken{{Calcio Hacken|N}}, squadra del circondario di Göteborg. Due settimane dopo segna una doppietta ai rivali cittadini del [[Djurgårdens Idrottsförening{{Calcio FotbollDjurgarden|Djurgården]]N}} nel derby di Stoccolma, festeggiando con una maglietta che recitava la scritta "hata Göteborg" (odio Göteborg), la quale ha portato a numerose polemiche.<ref>{{Cita web |lingua=SV |url=https://www.expressen.se/sport/fotboll/allsvenskan/hata-trojan-retar-blavitt/ |titolo="Hata"-tröjan retar Blåvitt |data=29 settembre 2009 |editore=expressen.se}}</ref>
L'ultima giornata del campionato 2009 prevedeva lo scontro diretto fra Göteborg{{Calcio Goteborg|N}} e AIK, chi avrebbe vinto la partita avrebbe festeggiato lo scudetto svedese: dopo il vantaggio dei padroni di casa biancoblu, è una rete di Antônio Flávio a pareggiare il match,<ref>{{Cita web |lingua=SV |url=https://www.aftonbladet.se/sportbladet/fotboll/sverige/allsvenskan/aik/article12078867.ab |titolo=AIK svenska mästare |data=1º novembre 2009 |editore=aftonbladet.se}}</ref> prima del sigillo definitivo di [[Daniel Tjernström|Tjernström]] per l'AIK. Viene confermato anche per la stagione successiva.
Nell'annata 2011 Antônio Flávio fa ritorno in Brasile, in prestito, per giocare nella [[Campeonato Brasileiro Série B|Série B brasiliana]] con la maglia del [[Associação{{Calcio Desportiva SãoSao Caetano|São Caetano]]N}}. Nel gennaio 2012 si trasferisce, questa volta a titolo definitivo, ai cinesi dello {{Calcio Shanghai Shenxin, club che verrà poi ribattezzato Nanchang Hengyuan all'inizio di quella stessa stagione|N}}.
