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Dal 15 maggio [[2010]] al 12 novembre [[2010]] Gabrielli è stato vicecapo del [[Dipartimento della Protezione Civile]], responsabile per l'area tecnico amministrativa e per la gestione delle risorse aeree.
[[File:Franco Gabrielli - Festival del Volontariato 2013.jpg|miniatura|sinistra|Gabrielli nel 2013 in veste di Capocapo del Dipartimento della protezione civile.]]
Dal 13 novembre [[2010]] ha assunto l'incarico di [[Capi del Dipartimento della protezione civile|Capocapo del Dipartimento della protezione civile]] nazionale, al posto di [[Guido Bertolaso]], che due giorni prima era andato in pensione<ref>[http://www.ilsole24ore.com/art/notizie/2010-11-12/prefetto-gabrielli-guida-protezione-231540.shtml?uuid=AYHGZEjC Il prefetto Gabrielli alla guida della protezione civile. Bertolaso: lascio una struttura ammaccata ma solida - Il Sole 24 ORE<!-- Titolo generato automaticamente -->]</ref>. Dopo le vicende<ref>[http://www.repubblica.it/cronaca/2013/09/27/news/grandi_eventi_bertolaso_balducci_e_anemone_rinviati_a_giudizio-67396627/ Grandi eventi, rinviati a giudizio Bertolaso, Balducci e Anemone - Repubblica.it<!-- Titolo generato automaticamente -->]</ref> legate agli appalti della Protezione Civile della gestione Bertolaso, Gabrielli ha sottoscritto un accordo<ref>[http://consip.it/press_room/comunicati/2012/3/notizia_0002?subFold=Altri%20comunicati Protezione civile e Consip: stipulata la convenzione per l'acquisizione di beni e servizi. L'accordo triennale faciliterà gli approvvigionamenti per la gestione delle emergenz...<!-- Titolo generato automaticamente -->] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20141129013254/http://consip.it/press_room/comunicati/2012/3/notizia_0002?subFold=Altri%20comunicati |data=29 novembre 2014 }}</ref> con la [[Consip]], la centrale acquisti nazionale, per facilitare - sotto la guida strategica della Protezione Civile - gli approvvigionamenti di gestione delle emergenze, secondo i migliori standard internazionali del cosiddetto ''emergency procurement''.
Dal 7 aprile [[2011]] al 31 dicembre [[2012]] è stato commissario delegato del Governo per l'[[Stato di emergenza|Emergenza]] immigrazione dal [[Nordafrica]]. Il 30 dicembre [[2011]], il [[Presidente del Consiglio dei ministri della Repubblica Italiana|Presidente del Consiglio]] [[Mario Monti]] lo ha confermato nell'incarico di [[Capi del Dipartimento della protezione civile|Capocapo del Dipartimento della protezione civile]]. Il 20 gennaio 2012, è stato nominato Commissario delegato per l'[[Stato di emergenza|Emergenza]] conseguente al [[naufragio della Costa Concordia|naufragio]] della motonave [[Costa Concordia]], avvenuto la sera del 13 gennaio [[2012]], nei pressi dell'[[Isola del Giglio]]. La gestione dell'emergenza, cui ha posto fine la delibera del Consiglio dei ministri del giorno 8 agosto [[2014]], si è sostanziata nel coordinamento delle attività pubbliche volte al controllo dell'azione del privato (armatore: [[Carnival Corporation & plc|Carnival]] ed assicuratori: P&I) cui era demandata la rimozione della nave. La nave è giunta nel [[porto di Pra']] (Genova) il giorno 27 luglio [[2014]], dopo 4 giorni di navigazione.
Dal 20 maggio al 29 luglio [[2012]] ha coordinato gli interventi emergenziali, conseguenti al sisma che ha colpito i territori delle province di [[Provincia di Modena|Modena]], [[Provincia di Ferrara|Ferrara]], [[Provincia di Reggio Emilia|Reggio Emilia]], [[Provincia di Bologna|Bologna]], [[Provincia di Mantova|Mantova]] e [[Provincia di Rovigo|Rovigo]]. Nell'occasione, stante il decreto legge 59/2012 che ha riformato la protezione civile, ha emanato le ordinanze necessarie alla gestione della prima emergenza, una delle principali novità del nuovo assetto normativo.
Il 7 giugno [[2013]], il [[Presidente del Consiglio dei ministri della Repubblica Italiana|Presidente del Consiglio]] [[Enrico Letta]] lo conferma nell'incarico di [[Capi del Dipartimento della protezione civile|Capocapo del Dipartimento della protezione civile]] e anche il Presidente del Consiglio [[Matteo Renzi]] lo conferma nell'incarico il 9 aprile [[2014]].<ref>{{cita web|url= http://www.protezionecivile.gov.it/jcms/it/view_prov.wp?facetNode_1=f4_4_3&prevPage=provvedimenti&facetNode_2=f4_4_3_2&catcode=f4_4_3&contentId=LEG45328|titolo= Sito web della Protezione Civile: dettaglio provvedimento|accesso= 13 ottobre 2014|dataarchivio= 18 ottobre 2014|urlarchivio= https://web.archive.org/web/20141018202147/http://www.protezionecivile.gov.it/jcms/it/view_prov.wp?facetNode_1=f4_4_3&prevPage=provvedimenti&facetNode_2=f4_4_3_2&catcode=f4_4_3&contentId=LEG45328|urlmorto= sì}}</ref>
Il 2 aprile [[2015]] il [[Governogoverno Renzi]] lo nomina [[Prefetti della provincia di Roma|prefetto di Roma]].<ref>{{cita web|url= http://www.governo.it/Governo/ConsiglioMinistri/dettaglio.asp?d=78195|titolo= Sito web del Governo Italiano: Consiglio dei Ministri n.55|accesso=2 aprile 2015}}</ref> Il 27 agosto 2015, in vista del [[Giubileo straordinario della misericordia|Giubileo]], lo stesso Renzi gli affida inoltre "il compito [...] di realizzare il necessario “raccordo operativo” tra le varie Istituzioni interessate".<ref>{{cita web|url= http://www.governo.it/Governo/ConsiglioMinistri/dettaglio.asp?d=79184|titolo= Consiglio dei Ministri n.78|editore= Governo Italiano|data= 27 agosto 2015|accesso= 28-8-2015}}</ref>
=== Capo della polizia e sottosegretario ===
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