L'ateneo ha ottenuto il 10 maggio 2006 il riconoscimento legale dal [[Ministero dell'università e della ricerca]]<ref>{{Cita web|url = https://www.gazzettaufficiale.it/eli/id/2006/06/12/06A05189/sg|titolo = Istituzione dell'universita' telematica internazionale non statale «Universitas Mercatorum»|autore = Ministero dell'istruzione, dell'università e della ricerca|sito = gazzettaufficiale.it|editore = Gazzetta ufficiale della Repubblica italiana|data = 12 giugno 2006|accesso = 26 agosto 2021|urlarchivio = https://web.archive.org/web/20210826202323/https://www.gazzettaufficiale.it/eli/id/2006/06/12/06A05189/sg|urlmorto = no}}</ref> che l'ha autorizzato a praticare la [[formazione a distanza]] attraverso l'impiego delle [[tecnologie dell'informazione e della comunicazione]].<ref>{{Cita web|url=https://www.lezioneonline.com/11-universita-telematiche-riconosciute-dal-miur/|titolo=Le Università Telematiche Riconosciute dal MIUR – LezioneOnline.com|autore=Renée|lingua=it|accesso=11 settembre 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210911200735/https://www.lezioneonline.com/11-universita-telematiche-riconosciute-dal-miur/|urlmorto=no}}</ref>. Pochi anni dopo [[Unione italiana delle Camere di commercio, industria, artigianato e agricoltura|Unioncamere]] ha ceduto i 2/3 del capitale sociale di Unimercatorum srl al gruppo [[Multiversity]].<ref>{{Cita news|autore = Carlo Festa|url = https://www.ilsole24ore.com/art/il-fondo-cvc-entra-nell-universita-pegaso-ACFz5tc|titolo = Il fondo Cvc entra nell’Università Pegaso|pubblicazione = Il Sole 24 Ore|data = 2 agosto 2019|accesso = 26 agosto 2021|urlarchivio = https://web.archive.org/web/20210826220437/https://www.ilsole24ore.com/art/il-fondo-cvc-entra-nell-universita-pegaso-ACFz5tc|urlmorto = no}}</ref><ref name="Nasce l'università delle Pmi all'insegna dell'innovazione: accordo Unioncamere-Pegaso .:: Unioncamere ::.">{{Cita web|url=https://www.unioncamere.gov.it/stampa/nasce-l-universit%C3%A0-delle-pmi-all-insegna-dell-innovazione--accordo-unioncamere-pegaso_2911.htm|titolo=Nasce l'università delle Pmi all'insegna dell'innovazione: accordo Unioncamere-Pegaso .:: Unioncamere ::.|accesso=27 agosto 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210827073412/https://www.unioncamere.gov.it/stampa/nasce-l-universit%C3%A0-delle-pmi-all-insegna-dell-innovazione--accordo-unioncamere-pegaso_2911.htm|urlmorto=no}}</ref><ref>{{Cita web|url=https://www.unioncamere.gov.it/P42A598C155S154/universitas-mercatorum.htm|titolo=Universitas Mercatorum|autore=simpar|data=14 luglio 2016|lingua=it|accesso=26 agosto 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210417133545/https://www.unioncamere.gov.it/P42A598C155S154/universitas-mercatorum.htm|urlmorto=no}}</ref>.
La denominazione ''Universitas Mercatorum'' richiama le origini, la natura e la vocazione tipica delle [[Camera di commercio|Camere di commercio]] quali organismi rappresentativi della comunità e, più specificatamente, della generalità dei vari soggetti ed ambiti produttivi. Le ''[[Universitas mercatorum mediolanensium|universitates mercatorum]]'' erano, infatti, organismi associativi – antesignani delle odierne camere di commercio – dispensatori di [[giustizia]] e investiti di funzioni di regolazione dei mercati, a tutela degli interessi di tutti i settori coinvolti.<ref>{{Cita web|url = http://temi.repubblica.it/guide-universita2009/2009/06/30/universitas-mercatorum/|titolo = Grande guida università 2009-2010: Universitas Mercatorum|wkautore = La Repubblica|sito = repubblica.it|editore = Gruppo editoriale L'Espresso|accesso = 26 agosto 2021|urlarchivio = https://web.archive.org/web/20200222134050/http://temi.repubblica.it/guide-universita2009/2009/06/30/universitas-mercatorum/|urlmorto = no}}</ref><ref>{{Cita web|url=https://www.unimercatorum.it/ateneo/chi-siamo|titolo=Chi Siamo {{!}} Universitas Mercatorum|sito=Università Telematica Universitas Mercatorum|lingua=it|accesso=28 agosto 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210828210222/https://www.unimercatorum.it/ateneo/chi-siamo|urlmorto=no}}</ref>.
Negli anni, ai corsi di laurea in ambito economico, si sono aggiunti corsi appartenenti ad altre aree, fra cui quelli presentirelativi nellealle risorse umane delle piccole e medie imprese.<ref name="Nasce l'università delle Pmi all'insegna dell'innovazione: accordo Unioncamere-Pegaso .:: Unioncamere ::." />. Il modello didattico prevalente è quello del [[blended learning]], che prevede l'alternanza fra momenti di formazione autonoma a distanza e altri di interazione, pure a distanza, con i docenti e il gruppo classe.<ref>{{Cita web|url=https://www.csimprese.it/P42A0C32S15/Universitas-Mercatorum.htm|titolo=Formazione >> Universitas Mercatorum .:: Centro Servizi per le Imprese ::.|accesso=27 agosto 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210826205950/https://www.csimprese.it/P42A0C32S15/Universitas-Mercatorum.htm|urlmorto=no}}</ref><ref>{{Cita web|url=https://agency.sm/area-news-generica/2008/12/28/universitas-mercatorum|titolo=Universitas Mercatorum|sito=Italiano|data=28 dicembre 2008|lingua=IT|accesso=27 agosto 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210827083414/https://agency.sm/area-news-generica/2008/12/28/universitas-mercatorum|urlmorto=no}}</ref>.
Gli [[Esame universitario|esami]] si svolgono in presenza, nella sede romana di [[Unioncamere]] o nelle 60 succursali diffuse in Italia.
Le attività di ricerca riguardano gli ambiti connessi con le imprese, sia nell'ambito della gestione aziendale, del diritto societario e commerciale, sia in riferimento al mercato del lavoro, all'imprenditorialità e all'innovazione.<ref>{{cita web |url=https://www.unimercatorum.it/ricerca/obiettivi-e-indirizzi-generali |titolo=Obiettivi e indirizzi generali della ricerca |sito=Unimercatorum.it |accesso=27 novembre 2023}}</ref>.