Convinto di essere figlio dell'attore [[Robert Vaughn]], poichécon il quale la madre vi aveva avuto una relazione, nel [[1980]] Vaughn ha scoperto – in seguito a un [[test di paternità]] – di essere figlio di George Albert Harley de Vere Drummond, aristocratico britannico.<ref>{{cita news|titolo=Vaughn's truth about son Matthew|nome=Karen|cognome=Hockney|data=25 aprile 2002|url=https://www.standard.co.uk/news/vaughns-truth-about-son-matthew-6298911.html|lingua=en}}</ref><ref>{{cita web|url=http://www.nydailynews.com/archives/gossip/claudia-labor-day-article-1.672293|titolo=Claudia Labor Day Article|lingua=en|accesso=18 aprile 2016|dataarchivio=30 marzo 2016|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20160330225141/http://www.nydailynews.com/archives/gossip/claudia-labor-day-article-1.672293|urlmorto=sì}}</ref><ref>{{cita web|titolo=Matthew Vaughn: The Director's Cut|https://www.independent.co.uk/news/people/profiles/matthew-vaughn-the-directors-cut-550697.html|lingua=en}}</ref>
Nel [[2002]] innel [[Suffolk]] Vaughn ha sposato [[Claudia Schiffer]]; la coppia ha tre bambini,: Caspar Matthew (2003), Clementine (2004) e Cosima Violet (2010).<ref name="Vogue">{{cita web|http://www.vogue.co.uk/news/2011/03/07/claudia-schiffer-unveils-her-debut-collection|titolo=Claudia Schiffer Unveils Her Debut Collection|editore= ''Vogue''|data=6 marzo 2012|lingua=en}}</ref>
