Trattandosi di un [[racemo]], esistono due enantiomeri dell'omeprazolo: l'R-enantiomero e l'S-enantiomero ([[esomeprazolo]]).
Nonostante ilalcune comunedifferenze meccanismoa livello di azione[[farmacocinetica]], tutte le diverse molecole degli IPP presentanonon sembrano avere profili di [[farmacocinetica]] ed efficacia clinica significativamente diversi tra loro, riconosciuti anche nei protocolli per l'eradicazione dell' ''Helicobacter Pylori'' e per la cura della malattia da reflusso gastroesofageo (GERD); in ambito di sanità pubblica e [[farmacoeconomia]], la scelta tra i diversi IPP non dovrebbe quindi tenere conto soltantoanche del minorerapporto costo di farmaci già genericicosti/benefici, qualiorientandola l'[[omeprazolo]],in madirezione anchedelle dell'interessemolecole del paziente e dell'appropriatezza prescrittiva, che dovrebberopiù indurreeconomiche a privilegiareparità esomeprazolodi aefficacia fronte(come diil specifiche esigenze cliniche[[lansoprazolo]])<ref>[http://www.regionesardegna.it/documenti/1_73_20060831112145.pdf Evidenze scientifiche sulla scelta degli IPP]</ref>.