Short interfering RNA: differenze tra le versioni
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==Specificità degli siRNA==
La RNAi si interseca con diversi altri processi cellulari. Non è dunque sorprendente che l'introduzione di siRNA nella cellula possa indurre alcuni effetti non specifici. Una cellula di [[mammifero]], ad esempio, può ''interpretare'' una molecola di RNAds come un composto di origine [[virus|virale]], avviando una risposta [[sistema immunitario|immunitaria]]<ref>{{en}} [http://www.biochemsoctrans.org/bst/032/0952/bst0320952.htm Sledz CA ''et al'' RNA interference and double-stranded-RNA-activated pathways. Biochem. Soc. Trans.. (2004) 32, (952–956)]</ref>. Inoltre, dal momento che i [[miRNA|microRNA]] (molecole prodotte dalla cellula per regolare l'[[espressione genica]]) sono estremamente simili come struttura ai siRNA, sono possibili indesiderate interferenze anche con questo ''pathway''.
===Immunità innata===
L'introduzione di troppo siRNA può generare diverse risposte cellulari aspecifiche in grado di attivare una risposta immunitaria innata. La maggior parte dei lavori scientifici sembra indicare che ciò sia dovuto alla presenza di PKR <ref>{{en}} [http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/abstract/112161228/ABSTRACT?CRETRY=1&SRETRY=0 Zhang Z ''et al'' siRNA binding proteins of microglial cells: PKR is an unanticipated ligand. J Cell Biochem. 2006 Apr 15;97(6):1217-29]</ref>, un ''sensore'' cellulare per gli RNAds, e sembra probabile il coinvolgimento anche del gene RIG-I (acronimo di ''retinoic acid inducible Gene I''). Un metodo promettente per ridurre l'effetto aspecifico consiste nell'adattare gli siRNA fino a far assumer loro la struttura di un microRNA. Dal momento che la presenza citosolica dei microRNA è assolutamente ''naturale'' e comporta uno dei più potenti meccanismi di silenziamento cellulare, tale approccio promette di essere molto efficace, permettendo di incorporare minori concentrazioni di siRNA per avere un silenziamento molto più efficiente e selettivo.
===Bersagli errati===
Si è riscontrato che alcuni mRNA non perfettamente complementari con la molecola di siRNA somministrata possono comunque andare incontro a degradazione<ref>{{en}} [http://www.nature.com/nmeth/journal/v3/n3/abs/nmeth854.html Birmingham A ''et al'' 3' UTR seed matches, but not overall identity, are associated with RNAi off-targets Nature Methods 3, 199 - 204 (2006)]</ref>. Questo comporta ulteriore aspecificità di azione degli siRNA. Questo problema, in ogni caso, può essere superato attraverso un oculato ''design'' dei siRNA. La costruzione di siRNA ''ottimizzati'' per ottenere la massima specificità viene comunemente svolta con il supporto di [[algoritmo|algoritmi]] in grado di selezionarne la composizione migliore. I numerosi studi in corso sull'[[espressione genica]] e sulle caratteristiche del [[-omics|trascrittoma]] stanno attualmente permettendo di raffinare tali algoritmi.
==Prospettive future==
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