La josamicina, può causare,così come tutti igli altri macrolidi, può causare disturbi gastrointestinali ([[nausea]], [[anoressia]], [[diarrea]]), manifestazioni allergiche (in particolare eruzioni cutanee,prurito,e ecc.prurito) e, talora, aumento delle [[transaminasi]].<ref Laname=Shigematsu1>{{cite josamicinajournal è|author=Shigematsu forseT, menoOi lesivaM, dell'[[eritromicina]]Kawamoto perT, ilKonnai T, Takeyasu K |title=[[trattoClinical experiments in the use of a macrolide antibiotic, Josamycin and its effects on the gastrointestinale]liver] (è|language=Japanese possibile|journal=Shikwa cheGakuho si|volume=71 tratti|issue=2 di|pages=703–7 una|year=1971 azione|month=February motilin-like).|pmid=5279686 |doi= |url=}}</ref><br>
La josamicina è forse meno lesiva dell'[[eritromicina]] per il [[tratto gastrointestinale]] (è possibile che si tratti di una azione motilin-like).
