Nel lago si trovano numerose isole, tra le quali le [[isole Kiži]], [[patrimonio dell'umanità]] dell'[[Unesco]], per la natura particolare ma soprattutto per gli edifici di legno, soprattutto chiese, che fanno parte di uno spettacolare museo etnografico all'aperto.
Il lago Onega è il secondo in Europa per la sua superficie (9720 km quadrati), dopo il Ladoga, ma è il più lungo ( più di 200 km) e soprattutto il più profondo (116 metri in media, contro i 51 del Ladoga). I suoi venti possono avere la violenza delle tempeste marine e provocare delle onde alte fino a 5 metri. È uno dei 26.000 laghi della repubblica della Carelia, chiamata anche "il paese dei laghi, delle foreste e dei graniti". I laghi rappresentano 30.000 km quadrati, cioè più di un sesto della superficie. La capitale Petrozavodsk, situata sulla riva ovest del lago, contava 25.000 abitanti nel 1925 e 280.000 oggi. Tutti questi piccoli laghi sono collegati tra loro da corsi d'acqua dal corso talvolta incerto, o accelerato da rapide o cascate. Il panorama si uniforma solo in inverno quando il manto nevoso ricopre tutto e i fiumi sono gelati da metà novembre. Il lago Onega è disseminato di isole e penisole, soprattutto al nord, che si estendono su parecchi chilometri. Con il Ladoga, l'Onega contribuisce all'abbondanza delle acque della Neva e alla regolarità dei suoi flussi. Questi aspetti favorevoli alla navigazione hanno portato, fin dal 1810, all'apertura del sistema Maria o Mariinski tra San Pietroburgo e , le cui tracce sono state riprese e allargate all'epoca sovietica.
