Jeremy individua un segnale del Mare Digitale e con l'aiuto di Aelita riprogramma la [[Veicoli di Code Lyoko#Skidbladnir|Skidbladnir]]. Intanto, [[William Dunbar (Code Lyoko)|William]] cerca di farsi riammettere nei Guerrieri Lyoko, ma nessuno si fida più di lui. Durante la missione, in cui Odd è assente, i Guerrieri scoprono un nuovo mondo, Cortex. Yumi e Ulrich si fanno devirtualizzare, ma non ritornano sulla Terra, così Aelita va nel Cuore di Lyoko alla ricerca dei loro codici. Qui viene attaccata da un [[Mostri di Code Lyoko#Krabe|Krabe]], ma William giunge in suo aiuto. Ripristinati i codici sorgente dei due amici, Aelita vede il fantasma di suo padre prima di andarsene.
