Cresciuto calcisticamente nelle file dell'Empoli, viene mandato in prestito in [[Serie C1]] nell'estate [[2007]] alla [[Unione Sportiva Massese 1919|Massese]], per essere poi richiamato alla base nella sessione invernale di calciomercato. Ha esordito in [[Serie A]] il [[19 marzo]] [[2008]] contro la [[Juventus Football Club|Juventus]], collezionando poi una seconda presenza il [[30 marzo]] seguente contro la [[Sampdoria]]. Dalla stagione seguente fa parte dei titolari dell'Empoli in [[Serie B]].
Il [[28 agosto]] [[2011]] passa in prestito al [[Parma Football Club|Parma]] con la formula del prestito con diritto di riscatto per metà del cartellino, in cambio [[Manuel Coppola]] passa alla società toscana in prestito secco.<ref>{{cita news|url=http://www.empolicalcio.net/Musacci-al-Parma-Manuel-Coppola-a-Empoli.htm|titolo=Musacci al Parma, Manuel Coppola a Empoli|data=28-08-2011|accesso=29-08-2011|autore=''empolicalcio.net''}}</ref>
Acquisita la comproprietà a fine stagione, il [[17 gennaio]] [[2013]] i ''ducali'' riscattano anche la seconda metà del cartellino del giocatore<ref>{{cita news|''empolicalcio.net''|http://www.empolicalcio.net/Musacci-tutto-al-Parma.htm|titolo=Musacci tutto al Parma|data=17-01-2013|accesso=18-01-2013|}}</ref>, che viene subito girato in [[Serie B]] allo [[Spezia Calcio|Spezia]] con la formula del prestito con diritto di riscatto della compartecipazione<ref>http://www.acspezia.com/notizie/Mercato-sulla-mediana-aquilotta-il-metronomo-Gianluca-Musacci.6808.html</ref>.
Esordisce con le ''aquile'' il [[26 gennaio]] nella gara casalinga contro il [[Hellas Verona Football Club|Verona]], persa per 1-0, partendo titolare e disputando tutti i novanta minuti.
