Sono stati messi in commercio tredue pacchetti di espansione del gioco. Il primo era ''Conflitti in Civilization'' che includeva 20 nuovi scenari, di cui 8 creati da [[fan]] del gioco. Aggiungeva anche un linguaggio a [[Macro (informatica)|macro]] per la generazione di eventi negli scenari. Uscì poi ''Fantastic Worlds'' che aggiungeva 19 scenari e migliorava ancora le capacità dell'editor di scenari. L'espansione definitiva è la ''Multiplayer Gold Edition'', una versione integrale del gioco che riuniva l'originale più le precedenti espansioni e dava per la prima volta la possibilità di giocare in [[multigiocatore]], in rete o sullo stesso PC.
''[[Civilization II: Test of Time]]'' è un'altra versione indipendente rilasciata nel [[1999]]. Era un prodotto a parte con nuove caratteristiche, come unità animate, supporto per mappe multiple nella stessa partita, e nuove modalità "campagna".