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Julialturner (talk | contribs) Improved formatting in html sections in code and added missing end tags |
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Line 215:
:addClass('infobox')
:css('width', '26.4em')
end
Line 233 ⟶ 232:
:css('font-weight', 'bold')
:wikitext(title)
:
:done() --end tr
end
Line 246:
root
:tag('tr')
:tag('td')
:attr('colspan', 4)
:css('text-align', 'center')
:wikitext(image)
:done() --end td
end
Line 289 ⟶ 290:
root
:tag('tr')
:tag('td')
:attr('colspan', 4)
:css('text-align', 'center')
:css('background-color', rowBGcolor)
:
:css('padding', '0')
:css('border', 'none')
Line 343 ⟶ 300:
:css('width', '100%')
:css('text-align', 'left')
:
:tag('th')
:attr('colspan', '4')
:css('text-align', 'center')
:css('background-color',titleBGcolor)
:wikitext(title)
:done() --end th
:done() --end tr
:tag('tr')
:tag('th')
:attr('rowspan', '2')
:css('background-color', sideTitleBGcolor)
:css('width', '43px')
:wikitext(pdb_link)
:done() --end th
:tag('td')
:attr('colspan', '2')
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:css('border', 'none')
:css('margin', '0')
:css('width', '100%')
:css('text-align', 'left')
:tag('tr')
:css('background-color',titleBGcolor)
:css('text-align', 'center')
:tag('th')
:attr('colspan', '2')
:wikitext(listTitle)
:done() --end th
:done() --end tr
:tag('tr')
:tag('td')
:attr('colspan', '2')
:css('background-color', rowBGcolor)
:tag('p')
:tag('span')
:attr('class', 'plainlinks')
:wikitext(pdbIDs)
:done() --end span
:done() --end p
:done() --end td
:done() --end tr
:done() --end table
:done() --end td
:done() --end tr
:done() --end table
:done() --end td
:done() --end tr
else
return ""
Line 459 ⟶ 457:
:css('background-color', titleBGcolor)
:wikitext(title)
:
:done() --end tr
:attr('scope', 'row')
:css('background-color', sideTitleBGcolor)
Line 468 ⟶ 466:
:attr('class', 'plainlinks')
:wikitext(label_aliases)
:done() --end span
:tag('td')
:attr('colspan','3')
Line 476 ⟶ 475:
:attr('class', 'plainlinks')
:wikitext(symbol_url)
:done() --end span
:wikitext(aliases)
:done() --end td
:done() --end tr
:tag('tr') :tag('th')
:attr('scope', 'row')
:css('background-color', sideTitleBGcolor)
:wikitext(label_ext_id)
:done() --end th
:tag('td')
:attr('colspan', '3')
Line 499 ⟶ 498:
:wikitext(IUPHAR)
:wikitext(genecards)
:done() --end span
if ec_no ~= "" then
root
:attr('scope', 'row')
:css('background-color', sideTitleBGcolor)
:wikitext(label_EC)
:done() --end th
:tag('td')
:attr('colspan', '3')
Line 517 ⟶ 516:
:attr('class', 'plainlinks')
:wikitext(EC)
:done() --end span
end
end
Line 541 ⟶ 540:
if ref_flag_all then
root
:tag('tr')
:tag('td')
:attr('colspan', 4)
:css('text-align', 'center')
:css('background-color', rowBGcolor)
:tag('tr') --create title bar
:tag('th')
:
:
:
:wikitext(title)
:done() --end th
:
:done() --end td
root
:css('background-color', rowBGcolor) :attr('scope', 'row')
:attr('colspan', '3')
:done() --end tr
end
Line 609 ⟶ 602:
if ref_flag_all then
root
:tag('tr')
:tag('td')
:attr('colspan', 4)
:css('text-align', 'center')
:css('background-color', rowBGcolor)
:tag('tr') --create title bar
:tag('th')
:
:
:
:wikitext(title)
:done() --end th
:
:done() --end td
--loop to create reference links from drug lists
Line 634 ⟶ 625:
local ref_link = drug_name..frame:extensionTag("ref",frame:expandTemplate{ title = 'cite_web', args = { title = title, url = ref_url} })
root
:tag('tr')
Line 640 ⟶ 630:
:css('text-align', 'center')
:css('background-color', rowBGcolor)
:tag('td')
:css('background-color', rowBGcolor)
Line 646 ⟶ 635:
:attr('colspan', '3')
:wikitext(ref_link)
:done() --end td
:done() --end tr
end
end
Line 670 ⟶ 657:
:css('text-align', 'center')
:css('background-color', rowBGcolor)
:tag('table')
:attr('class', 'collapsible collapsed')
Line 679 ⟶ 664:
:css('width', '100%')
:css('text-align', 'left')
:tag('tr') --create title bar
:tag('th')
:attr('colspan', '4')
:css('text-align', 'center')
:css('background-color', titleBGcolor)
:wikitext(title)
:done() --end th
:
:tag('th')
:css('background-color', sideTitleBGcolor)
:wikitext(mol_funct_title)
:done() --end th
:tag('td')
:css('background-color', rowBGcolor)
:
:
:
:
:done() --end td
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:done() --end tr
:
:
:
:
:tag('
:
:
:
:
:
:tag('tr')
:tag('td')
:css('background-color', rowBGcolor)
:css('text-align', 'center')
:attr('colspan', '4')
:wikitext("Sources:")
:wikitext(amigo_link)
:wikitext(" / ")
:wikitext(quickGO_link)
:done() --end td
:done() --end tr
:done() --end table
:done() --end td
:done() --end tr
end
Line 755 ⟶ 738:
:css('background-color', titleBGcolor)
:wikitext(title)
:done() --end th
:tag('tr')
:tag('td')
Line 763 ⟶ 746:
:css('background-color', rowBGcolor)
:wikitext(expression_images)
:done() --end td
:tag('tr')
:tag('td')
Line 773 ⟶ 756:
:attr('class', 'plainlinks')
:wikitext(biogps_link)
:done() --end span
:
:done() --end tr
end
Line 1,174 ⟶ 1,158:
:css('background-color', titleBGcolor)
:wikitext(title)
:done() --end th
:tag('tr')
:tag('th')
Line 1,181 ⟶ 1,165:
:css('background-color', sideTitleBGcolor)
:wikitext("Species")
:done() --end th
:tag('td')
:wikitext("'''Human'''")
:done() --end td
:tag('td')
:wikitext("'''Mouse'''")
:done() --end td
:tag('tr')
:tag('th')
Line 1,198 ⟶ 1,178:
:css('background-color', sideTitleBGcolor)
:wikitext(entrezTitle)
:done() --end th
:tag('td')
:
:
:tag('td')
:attr('colspan', '1')
:
:
:
:
:tag('td')
:
:
:
:
:
:
:
:tag('td')
:attr('colspan', '1')
:
:
:
:
:tag('tr')
:tag('th')
Line 1,269 ⟶ 1,241:
:css('background-color', sideTitleBGcolor)
:wikitext(ensemblTitle)
:done() --end th
:tag('td')
:
:
:tag('td')
:attr('colspan', '1')
:
:
:
:
:tag('td')
:
:
:
:
:
:
:
:tag('td')
:attr('colspan', '1')
:
:
:
:
:tag('tr')
:tag('th')
Line 1,340 ⟶ 1,304:
:css('background-color', sideTitleBGcolor)
:wikitext(uniprotTitle)
:done() --end th
:tag('td')
:
:
:tag('td')
:attr('colspan', '1')
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:tag('td')
:attr('colspan', '1')
:
:
:
:
:tag('tr')
:tag('th')
Line 1,411 ⟶ 1,367:
:css('background-color', sideTitleBGcolor)
:wikitext(refseq_mRNATitle)
:done() --end th
:tag('td') --RNASeq mRNA collapsible table
:tag('table')
:
:tag('td')
:attr('colspan', '1')
:
:tag('
:
:
:
:done() --end p
:tag('td') --RNASeq mRNA collapsible table for mouse
:tag('table')
:
:tag('td')
:attr('colspan', '1')
:
:tag('
:
:
:
:done() --end p
:tag('tr')
:tag('th')
Line 1,481 ⟶ 1,430:
:css('background-color', sideTitleBGcolor)
:wikitext(refseq_protTitle)
:done() --end th
:tag('td') --RNASeq protein collapsible table
:tag('table')
:
:tag('td')
:attr('colspan', '1')
:
:tag('
:
:
:
:done() --end p
:tag('td') --RNASeq protein collapsible table for mouse
:tag('table')
:
:tag('td')
:attr('colspan', '1')
:
:tag('
:
:
:
:done() --end p
:tag('tr')
:tag('th')
Line 1,551 ⟶ 1,493:
:css('background-color', sideTitleBGcolor)
:wikitext(locTitle)
:done() --end th
:tag('td')
:tag('span')
:attr('class', 'plainlinks')
:wikitext(chr_loc_link)
:done() --end span
:
:tag('td')
:tag('span')
:attr('class', 'plainlinks')
:wikitext(chr_loc_mm_link)
:done() --end span
:
:done() --end tr
:tag('tr')
:tag('th')
Line 1,570 ⟶ 1,512:
:css('background-color', sideTitleBGcolor)
:wikitext(pubmedTitle)
:done() --end th
:tag('td')
:tag('span')
:attr('class', 'plainlinks')
:wikitext(pubmed_link)
:done() --end span
:
:tag('td')
:tag('span')
:attr('class', 'plainlinks')
:wikitext(pubmed_mm_link)
:done() --end span
:wikitext(category_chromosome)
:done() --end td
:done() --end tr
end
p.formatRow = function(title)
root
:tag('td')
:attr('colspan', '4')
:css('text-align', 'center')
:css('background-color', rowBGcolor)
:tag('table')
:css('padding', '0')
Line 1,602 ⟶ 1,542:
:css('width', '100%')
:css('text-align', 'left')
:tag('tr') --create title header
:css('background-color',titleBGcolor)
Line 1,609 ⟶ 1,548:
:attr('colspan',"2")
:wikitext(title)
:done() --end th
:done() --end tr
:
:done() --end td
:done() --end tr
end
Line 1,633 ⟶ 1,574:
:tag('tr')
:tag('td')
:attr('colspan', '4')
:css('text-align', 'center')
:css('font-size','x-small')
:css('background-color', rowBGcolor)
:
:
:css('padding', '0')
:css('border', 'none')
:css('margin', '0')
:css('width', '100%')
:css('text-align', 'center')
:tag('tr')
:tag('td')
:attr('colspan', link_no_hs)
:css('background-color', rowBGcolor)
:css('text-align', 'center')
:css('font-size','x-small')
:wikitext(hs_link)
:done() --end td
:tag('td')
:attr('colspan', link_no_mm)
:css('background-color', rowBGcolor)
:css('text-align', 'center')
:css('font-size','x-small')
:wikitext(mm_link)
:done() --end td
:done() --end tr
:done() --end table
:done() --end tr
root:done() --end root table
end
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